More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1556 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1556  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 458 aa  921    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.392782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0851  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.38 
 
 		 466 aa  669    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2328  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.11 
 
 		 474 aa  662    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  56.03 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  56.09 
 
 		 475 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.17 
 
 		 482 aa  485  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.95 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.23 
 
 		 464 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.95 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  53.61 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.55 
 
 		 474 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.39 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.74 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.35 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.65 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.54 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.52 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.49 
 
 		 482 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.02 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.95 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.86 
 
 		 470 aa  478  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.86 
 
 		 470 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.64 
 
 		 475 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.44 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.44 
 
 		 467 aa  475  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.21 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.64 
 
 		 475 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.44 
 
 		 484 aa  474  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.34 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.53 
 
 		 476 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  56.07 
 
 		 487 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.19 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  53.35 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.22 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.22 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.2 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.99 
 
 		 493 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.45 
 
 		 537 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.75 
 
 		 519 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  54.48 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.98 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.44 
 
 		 483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.22 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.22 
 
 		 465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.63 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.08 
 
 		 474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.19 
 
 		 470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.99 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.23 
 
 		 474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.76 
 
 		 471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.32 
 
 		 472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.55 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.44 
 
 		 465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.42 
 
 		 476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.55 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  56.45 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.55 
 
 		 503 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.99 
 
 		 473 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.65 
 
 		 474 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.22 
 
 		 470 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2165  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.73 
 
 		 459 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.79 
 
 		 473 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.99 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  50.33 
 
 		 465 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.23 
 
 		 472 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  51.61 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 487 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.97 
 
 		 470 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 		 484 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1744  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 		 485 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  0.184526 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3203  ATP synthase F1, beta subunit  52.12 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 		 485 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.44 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.55 
 
 		 465 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.32 
 
 		 474 aa  461  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  52.86 
 
 		 468 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.83 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2807  ATP synthase F1, beta subunit  52.12 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.339111 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2148  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.23 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.46 
 
 		 483 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 		 509 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.98 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  54 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  54 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  51.79 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.66 
 
 		 468 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.66 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  51.19 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2794  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.32 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.33 
 
 		 465 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.33 
 
 		 465 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  51.89 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.66 
 
 		 504 aa  459  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.45 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.23 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.23 
 
 		 459 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 468 aa  457  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5431  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.01 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0419  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.45 
 
 		 512 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>