More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2165 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.37 
 
 		 460 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.81 
 
 		 460 aa  722    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  76.81 
 
 		 460 aa  722    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.05 
 
 		 463 aa  711    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.32 
 
 		 470 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.8 
 
 		 458 aa  727    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.81 
 
 		 460 aa  722    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.24 
 
 		 460 aa  741    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3317  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.43 
 
 		 467 aa  718    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.0243325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5431  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.02 
 
 		 458 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0062  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.86 
 
 		 461 aa  724    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.27 
 
 		 463 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3730  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.81 
 
 		 465 aa  700    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0372  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.89 
 
 		 476 aa  728    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.05 
 
 		 463 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  78.29 
 
 		 459 aa  732    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.7 
 
 		 472 aa  645    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.73 
 
 		 458 aa  710    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.19 
 
 		 458 aa  735    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0420  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.81 
 
 		 469 aa  710    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.17 
 
 		 464 aa  740    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.48 
 
 		 458 aa  737    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.48 
 
 		 458 aa  737    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4262  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.81 
 
 		 460 aa  722    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.227124  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.29 
 
 		 459 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.67 
 
 		 477 aa  714    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4114  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.32 
 
 		 466 aa  709    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.181857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.76 
 
 		 464 aa  714    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3346  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.43 
 
 		 467 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185597  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.55 
 
 		 459 aa  705    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.17 
 
 		 464 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 482 aa  648    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.17 
 
 		 464 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.12 
 
 		 458 aa  747    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5730  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.9 
 
 		 458 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.31 
 
 		 483 aa  730    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.25 
 
 		 468 aa  648    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.25 
 
 		 468 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.29 
 
 		 464 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.37 
 
 		 460 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.59 
 
 		 474 aa  716    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0485  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.57 
 
 		 466 aa  705    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.73 
 
 		 458 aa  711    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3526  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.03 
 
 		 474 aa  722    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.89 
 
 		 471 aa  731    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2165  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 459 aa  929    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.38 
 
 		 464 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.68 
 
 		 458 aa  735    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.38 
 
 		 458 aa  716    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.05 
 
 		 464 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.43 
 
 		 459 aa  744    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5200  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.58 
 
 		 458 aa  726    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.378441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.46 
 
 		 460 aa  727    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.78 
 
 		 462 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.17 
 
 		 464 aa  740    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.8 
 
 		 458 aa  727    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.16 
 
 		 462 aa  713    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.27 
 
 		 463 aa  713    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2148  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.31 
 
 		 461 aa  729    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.11 
 
 		 475 aa  720    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.17 
 
 		 464 aa  740    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.38 
 
 		 474 aa  716    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3966  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.15 
 
 		 470 aa  718    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000531769  normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.17 
 
 		 464 aa  740    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.87 
 
 		 465 aa  716    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0327  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.97 
 
 		 467 aa  714    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.713422  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.73 
 
 		 464 aa  735    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.84 
 
 		 463 aa  707    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.15 
 
 		 460 aa  719    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.6 
 
 		 458 aa  740    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.17 
 
 		 464 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2327  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.46 
 
 		 477 aa  710    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.568138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3494  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.86 
 
 		 467 aa  722    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000137861  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0141  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.03 
 
 		 457 aa  680    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.773497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.37 
 
 		 460 aa  722    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0480  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.03 
 
 		 471 aa  717    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.73 
 
 		 464 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  66.67 
 
 		 482 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.04 
 
 		 461 aa  746    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.27 
 
 		 463 aa  713    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.6 
 
 		 458 aa  719    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0122  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.73 
 
 		 464 aa  735    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.96 
 
 		 457 aa  739    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00421  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.65 
 
 		 467 aa  717    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.84 
 
 		 463 aa  708    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.84 
 
 		 463 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.34 
 
 		 458 aa  738    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.62 
 
 		 463 aa  708    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.46 
 
 		 458 aa  733    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.17 
 
 		 459 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.29 
 
 		 464 aa  737    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.68 
 
 		 458 aa  735    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4100  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.81 
 
 		 460 aa  722    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.740687  normal  0.359635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.89 
 
 		 466 aa  732    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2528  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.08 
 
 		 467 aa  723    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06104  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.59 
 
 		 461 aa  717    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.67 
 
 		 468 aa  726    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.73 
 
 		 464 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.58 
 
 		 458 aa  738    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.81 
 
 		 460 aa  722    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>