More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2989 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 		 474 aa  654    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 474 aa  958    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 		 518 aa  660    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 		 487 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.22 
 
 		 489 aa  672    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.36 
 
 		 474 aa  633  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.55 
 
 		 468 aa  633  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.61 
 
 		 509 aa  621  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.21 
 
 		 537 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 		 493 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.09 
 
 		 485 aa  624  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.86 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  56.99 
 
 		 476 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.82 
 
 		 493 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  52.61 
 
 		 465 aa  501  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  54.55 
 
 		 471 aa  502  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  53.03 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.01 
 
 		 474 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.34 
 
 		 483 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.42 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.16 
 
 		 468 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.32 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.16 
 
 		 468 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 468 aa  488  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.17 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.37 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.71 
 
 		 470 aa  487  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.83 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.83 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.83 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.59 
 
 		 473 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.27 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.49 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.83 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.39 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  51.63 
 
 		 464 aa  487  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.83 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.51 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  50.31 
 
 		 487 aa  481  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.35 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4097  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.35 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00195065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  52.77 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  51.19 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  53.1 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 		 482 aa  482  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.57 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.97 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.63 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.72 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3929  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.35 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.8 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.43 
 
 		 492 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.52 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.71 
 
 		 465 aa  481  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.6 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.4 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.42 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.98 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  50.43 
 
 		 547 aa  478  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.46 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.35 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.35 
 
 		 528 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 474 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  48.91 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.8 
 
 		 496 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.35 
 
 		 528 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.71 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.16 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.19 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.35 
 
 		 470 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 475 aa  475  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  51.84 
 
 		 482 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.42 
 
 		 462 aa  478  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 		 468 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.68 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.94 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.57 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.88 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.2 
 
 		 473 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.14 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.04 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.08 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>