More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1661 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.98 
 
 
509 aa  697    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.73 
 
 
474 aa  725    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 
474 aa  636    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.98 
 
 
468 aa  694    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
470 aa  955    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.06 
 
 
518 aa  748    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.65 
 
 
485 aa  678    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.75 
 
 
474 aa  707    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 
537 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.89 
 
 
493 aa  671    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.47 
 
 
487 aa  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.63 
 
 
489 aa  748    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.71 
 
 
462 aa  544  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.05 
 
 
482 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.57 
 
 
484 aa  481  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  51.43 
 
 
471 aa  478  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
482 aa  479  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  48.73 
 
 
482 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.02 
 
 
465 aa  475  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  48.67 
 
 
465 aa  475  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.57 
 
 
473 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.13 
 
 
465 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.13 
 
 
484 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.34 
 
 
462 aa  474  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.47 
 
 
484 aa  472  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.45 
 
 
474 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 
474 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  49.01 
 
 
464 aa  472  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  47.24 
 
 
465 aa  472  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.13 
 
 
465 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.34 
 
 
504 aa  471  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.89 
 
 
462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.02 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 
483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.8 
 
 
470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.58 
 
 
470 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  48.09 
 
 
487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.24 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.56 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.8 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  49.56 
 
 
468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.13 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.34 
 
 
471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.01 
 
 
462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  47.91 
 
 
465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  47.69 
 
 
465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  47.91 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.12 
 
 
462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.34 
 
 
472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.34 
 
 
467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1556  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.46 
 
 
458 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.392782  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.42 
 
 
475 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
467 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.2 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.58 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.43 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.58 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.22 
 
 
503 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16171  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.79 
 
 
486 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.68 
 
 
473 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_503  ATP synthase F1, beta subunit  49.22 
 
 
464 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0039983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.22 
 
 
464 aa  461  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.24 
 
 
509 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.29 
 
 
483 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  47.15 
 
 
465 aa  461  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.48 
 
 
474 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 
470 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.29 
 
 
483 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.48 
 
 
474 aa  463  1e-129  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  49.89 
 
 
467 aa  462  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.09 
 
 
493 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.45 
 
 
462 aa  464  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.22 
 
 
464 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  47.82 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 
492 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
488 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.56 
 
 
459 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.25 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  47.46 
 
 
472 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1531  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
486 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 
488 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16401  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
486 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.27 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  47.57 
 
 
462 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  48.57 
 
 
470 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 
468 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  48.12 
 
 
462 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.47 
 
 
519 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.09 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16281  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
486 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.01 
 
 
463 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2328  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 
474 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.13 
 
 
468 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
482 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.57 
 
 
472 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.78 
 
 
471 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 
459 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  47.16 
 
 
484 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.01 
 
 
463 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>