More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2315 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_5200  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
458 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.378441  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.72 
 
 
474 aa  635    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
472 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.25 
 
 
470 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 
471 aa  657    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0480  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
471 aa  634    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.51 
 
 
462 aa  655    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16171  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.15 
 
 
486 aa  817    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.86 
 
 
482 aa  811    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.32 
 
 
468 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.42 
 
 
480 aa  656    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 
465 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.93 
 
 
521 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15571  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.5 
 
 
488 aa  820    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.92 
 
 
482 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
469 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
469 aa  654    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
469 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.46 
 
 
517 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.93 
 
 
475 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 
463 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16401  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.1 
 
 
486 aa  820    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.44 
 
 
478 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
473 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
462 aa  635    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.29 
 
 
488 aa  814    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.62 
 
 
475 aa  637    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5018  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.71 
 
 
485 aa  819    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 
463 aa  636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.48 
 
 
476 aa  668    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.07 
 
 
482 aa  845    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 
509 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.14 
 
 
475 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 
463 aa  636    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.93 
 
 
475 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.28 
 
 
468 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.28 
 
 
468 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.88 
 
 
484 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
482 aa  648    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0504  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.86 
 
 
487 aa  820    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0754046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
462 aa  649    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2171  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.44 
 
 
487 aa  814    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
470 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 
470 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.04 
 
 
481 aa  668    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
469 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.34 
 
 
482 aa  641    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1531  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.15 
 
 
486 aa  815    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
484 aa  974    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16281  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.77 
 
 
486 aa  821    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.83 
 
 
476 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.92 
 
 
462 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.92 
 
 
482 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.92 
 
 
482 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
469 aa  655    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.62 
 
 
476 aa  663    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.05 
 
 
481 aa  649    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 
470 aa  661    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 
471 aa  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.63 
 
 
474 aa  639    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  84.62 
 
 
482 aa  833    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 
468 aa  651    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  70 
 
 
476 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05021  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.6 
 
 
532 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.92 
 
 
470 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 
463 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3652  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.83 
 
 
478 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.62 
 
 
476 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 
463 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.31 
 
 
476 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  67.51 
 
 
530 aa  643    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.92 
 
 
470 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.35 
 
 
465 aa  656    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0343  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.08 
 
 
483 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.87 
 
 
513 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.32 
 
 
464 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.98 
 
 
537 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.71 
 
 
488 aa  816    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.21 
 
 
519 aa  663    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
484 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.74 
 
 
483 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.66 
 
 
467 aa  641    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.09 
 
 
484 aa  809    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.8 
 
 
484 aa  645    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.36 
 
 
475 aa  647    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.32 
 
 
468 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.41 
 
 
476 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
464 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
468 aa  652    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
465 aa  635    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 
484 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.83 
 
 
471 aa  669    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
462 aa  644    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.62 
 
 
471 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 
465 aa  644    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0420  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
469 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.32 
 
 
469 aa  656    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 
469 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.06 
 
 
484 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 
462 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>