More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2171 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.71 
 
 		 470 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.52 
 
 		 462 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 		 470 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 475 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 		 462 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.63 
 
 		 482 aa  777    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.55 
 
 		 474 aa  645    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5018  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.89 
 
 		 485 aa  777    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16401  F0F1 ATP synthase subunit beta  91.34 
 
 		 486 aa  880    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 		 521 aa  634    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16281  F0F1 ATP synthase subunit beta  91.34 
 
 		 486 aa  881    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 		 521 aa  634    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.86 
 
 		 470 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  68.92 
 
 		 487 aa  677    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0420  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.18 
 
 		 469 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 		 517 aa  636    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  90.14 
 
 		 488 aa  878    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05021  F0F1 ATP synthase subunit beta  91.38 
 
 		 532 aa  878    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.99 
 
 		 473 aa  646    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 		 481 aa  662    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.67 
 
 		 476 aa  652    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.49 
 
 		 482 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.71 
 
 		 482 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.6 
 
 		 476 aa  656    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 		 471 aa  639    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 475 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.57 
 
 		 468 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.57 
 
 		 468 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 465 aa  637    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.45 
 
 		 482 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0504  F0F1 ATP synthase subunit beta  95.48 
 
 		 487 aa  919    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0754046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 462 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2171  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 487 aa  980    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.57 
 
 		 470 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  82.13 
 
 		 482 aa  796    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 484 aa  635    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1531  F0F1 ATP synthase subunit beta  91.13 
 
 		 486 aa  878    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.44 
 
 		 484 aa  814    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.51 
 
 		 471 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.64 
 
 		 462 aa  656    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.42 
 
 		 464 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 		 482 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.02 
 
 		 476 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.71 
 
 		 481 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 471 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.71 
 
 		 470 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 		 474 aa  637    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 462 aa  638    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.81 
 
 		 476 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.04 
 
 		 483 aa  786    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.04 
 
 		 483 aa  786    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 475 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.02 
 
 		 476 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.71 
 
 		 482 aa  650    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.02 
 
 		 476 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  65.97 
 
 		 471 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  64.96 
 
 		 530 aa  635    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 474 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  69.05 
 
 		 465 aa  646    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 		 470 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.62 
 
 		 519 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 		 465 aa  645    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.26 
 
 		 480 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.76 
 
 		 484 aa  759    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.99 
 
 		 478 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.57 
 
 		 476 aa  640    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  89.94 
 
 		 488 aa  877    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 		 465 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 464 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 462 aa  634    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16171  F0F1 ATP synthase subunit beta  91.13 
 
 		 486 aa  876    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 471 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.16 
 
 		 509 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  68.71 
 
 		 467 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15571  F0F1 ATP synthase subunit beta  90.55 
 
 		 488 aa  884    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.99 
 
 		 473 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 		 465 aa  636    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  65.7 
 
 		 518 aa  634  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 		 484 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 		 472 aa  633  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.58 
 
 		 469 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.58 
 
 		 469 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.58 
 
 		 469 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  65 
 
 		 477 aa  632  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.43 
 
 		 484 aa  634  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.58 
 
 		 469 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 462 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  67.16 
 
 		 503 aa  634  1e-180  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  66.1 
 
 		 468 aa  634  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.31 
 
 		 513 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.64 
 
 		 478 aa  631  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.37 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.78 
 
 		 482 aa  631  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 		 465 aa  634  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.25 
 
 		 474 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.37 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 467 aa  634  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 465 aa  630  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 484 aa  628  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.45 
 
 		 474 aa  628  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>