More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3385 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0480  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
471 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.34 
 
 
470 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.32 
 
 
517 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.89 
 
 
470 aa  683    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
458 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
462 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 
460 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.04 
 
 
475 aa  639    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
475 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.53 
 
 
468 aa  661    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 
466 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 
465 aa  649    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 
521 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
463 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  68.09 
 
 
459 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
469 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
469 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
469 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05021  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.8 
 
 
532 aa  765    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.49 
 
 
470 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 
484 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  68.79 
 
 
547 aa  639    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
459 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 
477 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.65 
 
 
463 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.86 
 
 
488 aa  767    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3346  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 
467 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185597  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.11 
 
 
507 aa  639    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
458 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.18 
 
 
476 aa  653    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.48 
 
 
482 aa  845    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16401  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.44 
 
 
486 aa  783    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.37 
 
 
458 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.28 
 
 
488 aa  769    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 
475 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.55 
 
 
468 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.55 
 
 
468 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 
465 aa  649    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
482 aa  651    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0504  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.22 
 
 
487 aa  771    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0754046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.72 
 
 
462 aa  656    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2171  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.76 
 
 
487 aa  759    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.68 
 
 
470 aa  680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.92 
 
 
470 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.54 
 
 
509 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.11 
 
 
469 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.25 
 
 
468 aa  638    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1531  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.88 
 
 
486 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.09 
 
 
484 aa  809    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  71.34 
 
 
503 aa  655    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.25 
 
 
471 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 
474 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.97 
 
 
462 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16281  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.88 
 
 
486 aa  784    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.54 
 
 
482 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.46 
 
 
471 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.62 
 
 
476 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.35 
 
 
481 aa  658    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 
474 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  84.65 
 
 
482 aa  839    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 
474 aa  677    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 
474 aa  650    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.5 
 
 
463 aa  648    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 
476 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 
468 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0327  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
467 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.713422  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0372  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
476 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.678758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.65 
 
 
463 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.62 
 
 
476 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  68.35 
 
 
530 aa  655    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 
476 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2327  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.25 
 
 
477 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.568138  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.45 
 
 
458 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4332  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
480 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551629  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.1 
 
 
474 aa  673    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.72 
 
 
513 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16171  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.03 
 
 
486 aa  776    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.33 
 
 
480 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.92 
 
 
476 aa  660    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.59 
 
 
519 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.51 
 
 
458 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.4 
 
 
521 aa  648    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
465 aa  634    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
458 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
484 aa  974    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 
463 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.44 
 
 
463 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
471 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
463 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.22 
 
 
476 aa  635    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.94 
 
 
462 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
464 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.51 
 
 
458 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
474 aa  659    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 
472 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.21 
 
 
537 aa  659    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 
475 aa  652    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 
475 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.65 
 
 
463 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.57 
 
 
474 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>