More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0463 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.26 
 
 
474 aa  720    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
485 aa  993    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.42 
 
 
474 aa  639    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.14 
 
 
468 aa  693    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.82 
 
 
509 aa  722    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.67 
 
 
470 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.54 
 
 
518 aa  764    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.17 
 
 
537 aa  709    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.88 
 
 
489 aa  753    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.88 
 
 
487 aa  723    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.38 
 
 
493 aa  692    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.95 
 
 
474 aa  745    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.17 
 
 
462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  51.1 
 
 
465 aa  495  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.41 
 
 
483 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.71 
 
 
474 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  51.55 
 
 
464 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.65 
 
 
496 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.56 
 
 
473 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.86 
 
 
489 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.57 
 
 
482 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  51.31 
 
 
471 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.21 
 
 
493 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.53 
 
 
492 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  48.88 
 
 
487 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
467 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  49.35 
 
 
482 aa  485  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.99 
 
 
465 aa  486  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
468 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 
472 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
503 aa  482  1e-135  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.04 
 
 
476 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.32 
 
 
528 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 
484 aa  479  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.32 
 
 
528 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 
464 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.46 
 
 
475 aa  476  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.56 
 
 
470 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.56 
 
 
470 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.06 
 
 
469 aa  476  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  51.64 
 
 
467 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 
504 aa  475  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.23 
 
 
470 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 
474 aa  472  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
465 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
465 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.55 
 
 
467 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 
465 aa  473  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  49.01 
 
 
465 aa  474  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  50.55 
 
 
468 aa  472  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
462 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
465 aa  471  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
465 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
469 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.16 
 
 
465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 
458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 
458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 
467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.56 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.44 
 
 
462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  49 
 
 
482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.23 
 
 
470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.45 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 
471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.13 
 
 
483 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0424  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.23 
 
 
466 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.02 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.13 
 
 
483 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 
462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  48.78 
 
 
462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
484 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4097  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.01 
 
 
464 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00195065  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.2 
 
 
472 aa  468  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.57 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.13 
 
 
463 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.68 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0485  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.8 
 
 
466 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.91 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.65 
 
 
488 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.28 
 
 
507 aa  466  9.999999999999999e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.25 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.57 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.39 
 
 
475 aa  465  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.33 
 
 
459 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.57 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.78 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.47 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0419  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.39 
 
 
512 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.57 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2794  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.63 
 
 
534 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 
488 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
471 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3929  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.78 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114623  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.23 
 
 
465 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.34 
 
 
513 aa  468  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.57 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.06 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>