More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02210 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  75.94 
 
 
413 aa  647    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  59.09 
 
 
623 aa  764    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  100 
 
 
618 aa  1282    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  63.56 
 
 
617 aa  803    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  51.02 
 
 
586 aa  601  1e-170  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  54.26 
 
 
586 aa  593  1e-168  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  50.5 
 
 
590 aa  589  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  53.7 
 
 
586 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  51.95 
 
 
582 aa  591  1e-167  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  50.76 
 
 
589 aa  591  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  50.93 
 
 
578 aa  585  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  51.1 
 
 
582 aa  587  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  53.52 
 
 
586 aa  586  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  53.7 
 
 
586 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  51.54 
 
 
588 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.32 
 
 
578 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50.25 
 
 
589 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  50.51 
 
 
588 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  49.5 
 
 
591 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  49.5 
 
 
591 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.71 
 
 
576 aa  578  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  52.87 
 
 
584 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  52.21 
 
 
582 aa  566  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  53.06 
 
 
588 aa  565  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  52.59 
 
 
587 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  50.34 
 
 
584 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  50.6 
 
 
587 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  48.05 
 
 
585 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  49.72 
 
 
592 aa  559  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  49.41 
 
 
587 aa  558  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  50 
 
 
569 aa  560  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  48.99 
 
 
590 aa  558  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  48.32 
 
 
592 aa  558  1e-157  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.41 
 
 
588 aa  558  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  47.47 
 
 
591 aa  555  1e-156  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  49.15 
 
 
578 aa  555  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  47.9 
 
 
589 aa  552  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  53.8 
 
 
581 aa  555  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  52.78 
 
 
586 aa  546  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  52.21 
 
 
591 aa  534  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  47.53 
 
 
576 aa  531  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  45.69 
 
 
582 aa  523  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  44.39 
 
 
601 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  46.67 
 
 
586 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  46.19 
 
 
588 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  44.35 
 
 
593 aa  503  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.42 
 
 
594 aa  501  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  45.06 
 
 
594 aa  497  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  43.83 
 
 
593 aa  492  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  44.86 
 
 
579 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  46.41 
 
 
579 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  43.43 
 
 
594 aa  486  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  44.86 
 
 
579 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  43.2 
 
 
578 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  42.95 
 
 
591 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  72.07 
 
 
1065 aa  461  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  44.12 
 
 
595 aa  452  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  42.47 
 
 
524 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.59 
 
 
575 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  36.4 
 
 
607 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  36.46 
 
 
607 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  40.4 
 
 
591 aa  374  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  42.33 
 
 
589 aa  371  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  37.52 
 
 
589 aa  360  4e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  35.75 
 
 
575 aa  351  2e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  37.43 
 
 
584 aa  347  3e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.49 
 
 
587 aa  346  8.999999999999999e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.09 
 
 
471 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.78 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.4 
 
 
471 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.21 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.19 
 
 
465 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  29 
 
 
465 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  31.69 
 
 
471 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.09 
 
 
476 aa  144  5e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  30.91 
 
 
493 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  31.19 
 
 
495 aa  140  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  30.94 
 
 
493 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.46 
 
 
490 aa  140  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.82 
 
 
485 aa  140  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  33.02 
 
 
483 aa  140  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.25 
 
 
491 aa  140  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  33.23 
 
 
474 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.31 
 
 
486 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  30.43 
 
 
487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  30.94 
 
 
470 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.55 
 
 
480 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.38 
 
 
475 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.12 
 
 
484 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
465 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  29.91 
 
 
485 aa  137  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  28.72 
 
 
479 aa  136  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  32.06 
 
 
492 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  27.29 
 
 
470 aa  136  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.63 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  28.98 
 
 
495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  28.85 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.5 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  30 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.85 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>