More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1615 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  61.67 
 
 
590 aa  728    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  52.12 
 
 
592 aa  635    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  90.1 
 
 
586 aa  1093    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.91 
 
 
578 aa  645    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  61 
 
 
588 aa  702    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  98.81 
 
 
586 aa  1182    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  61.17 
 
 
584 aa  689    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  57.24 
 
 
587 aa  661    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  59.35 
 
 
578 aa  691    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  95.56 
 
 
586 aa  1154    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  60.07 
 
 
591 aa  639    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 
586 aa  1194    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.26 
 
 
588 aa  691    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  64.27 
 
 
582 aa  747    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  60.14 
 
 
582 aa  694    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  60.22 
 
 
584 aa  689    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  59.89 
 
 
588 aa  671    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  59.86 
 
 
578 aa  705    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  58.89 
 
 
589 aa  694    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  59.97 
 
 
588 aa  702    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  61.88 
 
 
591 aa  750    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  61.88 
 
 
591 aa  749    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.38 
 
 
576 aa  639    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  60.78 
 
 
589 aa  711    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  57.19 
 
 
587 aa  669    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  61.43 
 
 
589 aa  733    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  57.34 
 
 
585 aa  706    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  82.08 
 
 
586 aa  996    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  58.08 
 
 
587 aa  667    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  54.87 
 
 
576 aa  641    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  58.08 
 
 
586 aa  673    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.82 
 
 
592 aa  667    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.43 
 
 
569 aa  717    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  52.72 
 
 
591 aa  652    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  59.79 
 
 
581 aa  678    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  55.73 
 
 
590 aa  628  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  54.26 
 
 
582 aa  606  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  56.34 
 
 
586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  50.78 
 
 
601 aa  601  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  53.7 
 
 
618 aa  589  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  52.39 
 
 
588 aa  587  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  51.24 
 
 
617 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  48.98 
 
 
593 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.83 
 
 
582 aa  570  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  48.29 
 
 
594 aa  567  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  48.3 
 
 
593 aa  568  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  49.4 
 
 
579 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  47.11 
 
 
594 aa  566  1e-160  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  52.05 
 
 
579 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  52.24 
 
 
579 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  48.74 
 
 
623 aa  556  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  48.89 
 
 
578 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.2 
 
 
594 aa  551  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  47.73 
 
 
591 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  49.11 
 
 
595 aa  535  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  45.68 
 
 
524 aa  475  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.46 
 
 
575 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  44.31 
 
 
607 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  44.31 
 
 
607 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  55.56 
 
 
413 aa  428  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  43.38 
 
 
584 aa  417  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  43.36 
 
 
589 aa  408  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  41.36 
 
 
575 aa  405  1.0000000000000001e-112  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  43.59 
 
 
591 aa  403  1e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  40.22 
 
 
589 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.86 
 
 
587 aa  390  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  51.14 
 
 
1065 aa  320  5e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  27.23 
 
 
504 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  29.6 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  30.59 
 
 
431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  30.7 
 
 
440 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  29.6 
 
 
427 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  28.81 
 
 
474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.57 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  31.38 
 
 
471 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  34.26 
 
 
443 aa  130  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.66 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0144  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.56 
 
 
464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.801647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  32.98 
 
 
440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  33.46 
 
 
442 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.42 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  33.33 
 
 
479 aa  127  5e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.35 
 
 
471 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.91 
 
 
465 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  31.27 
 
 
434 aa  126  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  28.99 
 
 
470 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.91 
 
 
465 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.97 
 
 
471 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.21 
 
 
484 aa  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.91 
 
 
484 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  34.08 
 
 
440 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  32.63 
 
 
439 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  30.12 
 
 
439 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  28.84 
 
 
422 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.41 
 
 
464 aa  124  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.63 
 
 
503 aa  123  9e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  25.94 
 
 
475 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  29.5 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.37 
 
 
472 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.06 
 
 
474 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>