More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0582 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 
591 aa  1217    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  55.45 
 
 
589 aa  599  1e-170  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  51.46 
 
 
575 aa  576  1.0000000000000001e-163  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  52.27 
 
 
607 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  53.69 
 
 
607 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  48.79 
 
 
589 aa  541  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.23 
 
 
587 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  44.91 
 
 
584 aa  496  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  46.69 
 
 
590 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.2 
 
 
588 aa  436  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  47.33 
 
 
591 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  47.33 
 
 
591 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  42.5 
 
 
588 aa  430  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  44.19 
 
 
585 aa  432  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  46.55 
 
 
582 aa  431  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  42.41 
 
 
589 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  40.24 
 
 
588 aa  421  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  40.59 
 
 
582 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  41.43 
 
 
578 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.49 
 
 
569 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  44.12 
 
 
589 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  40.81 
 
 
584 aa  415  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  42.32 
 
 
586 aa  414  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  45.16 
 
 
587 aa  409  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  44.12 
 
 
587 aa  409  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  42.4 
 
 
587 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  41.2 
 
 
589 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  44.96 
 
 
586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  41.77 
 
 
586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  42.18 
 
 
590 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  43.59 
 
 
586 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  41.9 
 
 
601 aa  403  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  42.2 
 
 
591 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  43.78 
 
 
578 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  43.39 
 
 
586 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  44.33 
 
 
584 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  40.63 
 
 
581 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  43.39 
 
 
586 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.67 
 
 
576 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  41.45 
 
 
588 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  42.09 
 
 
586 aa  394  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  40.95 
 
 
582 aa  395  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  41.78 
 
 
582 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  42.11 
 
 
576 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  41.12 
 
 
592 aa  386  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.82 
 
 
578 aa  382  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  39.52 
 
 
592 aa  380  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  41.05 
 
 
591 aa  382  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.8 
 
 
594 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  41.11 
 
 
588 aa  379  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  40.4 
 
 
618 aa  374  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  39.84 
 
 
617 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  39.74 
 
 
591 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  40.36 
 
 
595 aa  368  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  39.88 
 
 
593 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  43.03 
 
 
579 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  42.83 
 
 
579 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  40.16 
 
 
594 aa  352  2e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  43.03 
 
 
579 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  35.59 
 
 
623 aa  351  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  39.49 
 
 
593 aa  349  8e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  39.25 
 
 
578 aa  347  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  39.61 
 
 
594 aa  340  5e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  39.18 
 
 
524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.02 
 
 
575 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  43.72 
 
 
413 aa  297  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  39.37 
 
 
1065 aa  223  8e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  26.8 
 
 
438 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  26.47 
 
 
427 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  32.22 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  27.6 
 
 
449 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  32.08 
 
 
460 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  27.94 
 
 
435 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  28.81 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  27.86 
 
 
431 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  31.69 
 
 
448 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  27.65 
 
 
435 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1877  ATPase, FliI/YscN family  30.42 
 
 
461 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.23531  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4199  ATPase FliI/YscN  30.54 
 
 
440 aa  110  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  27.57 
 
 
442 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  30.65 
 
 
442 aa  109  2e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  28.26 
 
 
443 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  29.23 
 
 
458 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.9 
 
 
476 aa  108  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  29.23 
 
 
458 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  30.25 
 
 
444 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  28.91 
 
 
449 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  28.74 
 
 
449 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  29.84 
 
 
439 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  28.63 
 
 
519 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1161  flagellar protein export ATPase FliI  27.76 
 
 
458 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489016  normal  0.0133257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  28.57 
 
 
547 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  26.93 
 
 
470 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  25.75 
 
 
509 aa  108  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  29.05 
 
 
443 aa  108  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  25.75 
 
 
526 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  27.86 
 
 
432 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  28.22 
 
 
513 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0231  flagellar protein export ATPase FliI  25.75 
 
 
523 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228517  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  28.57 
 
 
446 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>