More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3442 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  58.94 
 
 		 590 aa  741    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.85 
 
 		 582 aa  645    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  55.19 
 
 		 582 aa  638    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  52.74 
 
 		 590 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 		 588 aa  1212    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  56.15 
 
 		 586 aa  683    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  56.46 
 
 		 587 aa  632  1e-180  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.19 
 
 		 594 aa  631  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  54.46 
 
 		 578 aa  627  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  54.41 
 
 		 586 aa  623  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  55.62 
 
 		 587 aa  621  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  55.68 
 
 		 587 aa  617  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  50.69 
 
 		 589 aa  616  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.34 
 
 		 589 aa  617  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  49.14 
 
 		 592 aa  616  1e-175  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50.95 
 
 		 589 aa  609  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  49.83 
 
 		 585 aa  610  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  51.72 
 
 		 578 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  56.95 
 
 		 584 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  56.2 
 
 		 588 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  50.17 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  50.17 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  56.59 
 
 		 588 aa  600  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  52.77 
 
 		 586 aa  596  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  50.97 
 
 		 586 aa  592  1e-168  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.14 
 
 		 588 aa  593  1e-168  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  55.43 
 
 		 581 aa  593  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  51.95 
 
 		 586 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  53.37 
 
 		 591 aa  589  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.71 
 
 		 569 aa  588  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  52.57 
 
 		 586 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.48 
 
 		 576 aa  585  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  50.87 
 
 		 582 aa  585  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  50.81 
 
 		 584 aa  588  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  50.61 
 
 		 588 aa  586  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  52.39 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  50.36 
 
 		 576 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.74 
 
 		 578 aa  574  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  48 
 
 		 582 aa  570  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  46.25 
 
 		 592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  45.98 
 
 		 591 aa  564  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  46.76 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  47.3 
 
 		 601 aa  557  1e-157  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  49.08 
 
 		 617 aa  525  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  46.19 
 
 		 618 aa  514  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  48.04 
 
 		 579 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  47.29 
 
 		 579 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  47.48 
 
 		 579 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  47.68 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  43.94 
 
 		 595 aa  503  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  44.58 
 
 		 593 aa  501  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  44.46 
 
 		 594 aa  496  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  43.15 
 
 		 594 aa  490  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  43.39 
 
 		 593 aa  489  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  46.29 
 
 		 623 aa  490  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.94 
 
 		 575 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  44.29 
 
 		 524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  42.21 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  42.21 
 
 		 607 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  40 
 
 		 575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  39.71 
 
 		 584 aa  403  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  40.79 
 
 		 589 aa  402  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  41.45 
 
 		 591 aa  396  1e-109  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.55 
 
 		 587 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  38.38 
 
 		 589 aa  389  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  48.24 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  48.09 
 
 		 1065 aa  290  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  33.47 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  33.47 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  35.34 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  34.47 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  31.78 
 
 		 442 aa  135  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  32.81 
 
 		 442 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.85 
 
 		 483 aa  130  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  32.68 
 
 		 436 aa  129  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  28.06 
 
 		 435 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  29.71 
 
 		 442 aa  127  8.000000000000001e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  31.16 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  32 
 
 		 422 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.55 
 
 		 471 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.97 
 
 		 469 aa  124  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  32.18 
 
 		 489 aa  123  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  30.77 
 
 		 439 aa  123  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  30.95 
 
 		 437 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  32.41 
 
 		 426 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.2 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  30.87 
 
 		 435 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1116  flagellar protein export ATPase FliI  31.47 
 
 		 470 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  32.77 
 
 		 443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  32.51 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  31.05 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  30.47 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  29.81 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  31.65 
 
 		 446 aa  122  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.3 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  31.2 
 
 		 435 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  29.74 
 
 		 432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  32.27 
 
 		 437 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  32.51 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  28.21 
 
 		 466 aa  120  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>