More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0256 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  58.26 
 
 		 586 aa  691    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.65 
 
 		 576 aa  652    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  58.43 
 
 		 586 aa  693    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  58.35 
 
 		 582 aa  698    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  100 
 
 		 588 aa  1210    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  58 
 
 		 586 aa  700    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  58.93 
 
 		 586 aa  697    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  58.24 
 
 		 578 aa  667    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  62.3 
 
 		 569 aa  757    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  55.42 
 
 		 584 aa  654    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  56.38 
 
 		 582 aa  673    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  56.65 
 
 		 584 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  56.25 
 
 		 588 aa  650    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  57.14 
 
 		 578 aa  689    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  55.86 
 
 		 587 aa  646    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  55 
 
 		 588 aa  654    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  55.08 
 
 		 582 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  67.18 
 
 		 589 aa  827    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  73.8 
 
 		 591 aa  893    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  73.8 
 
 		 591 aa  892    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  59.28 
 
 		 586 aa  702    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  58.82 
 
 		 589 aa  718    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  54.77 
 
 		 587 aa  646    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  69.14 
 
 		 585 aa  849    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.05 
 
 		 578 aa  655    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  64.1 
 
 		 589 aa  790    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  66.27 
 
 		 590 aa  814    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  54.12 
 
 		 588 aa  647    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  55 
 
 		 586 aa  642    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.06 
 
 		 592 aa  632  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  54.48 
 
 		 587 aa  633  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  54.06 
 
 		 581 aa  628  1e-179  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  51.29 
 
 		 592 aa  625  1e-178  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  50 
 
 		 591 aa  625  1e-178  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  52.75 
 
 		 590 aa  625  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  53.77 
 
 		 591 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  51.39 
 
 		 576 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.97 
 
 		 586 aa  599  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  49.14 
 
 		 588 aa  593  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  51.38 
 
 		 617 aa  590  1e-167  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.66 
 
 		 594 aa  588  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  46.84 
 
 		 601 aa  587  1e-166  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  50.9 
 
 		 579 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  50.54 
 
 		 579 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  49.04 
 
 		 582 aa  566  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  50.36 
 
 		 579 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  49.4 
 
 		 578 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  47.41 
 
 		 618 aa  558  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  48.93 
 
 		 623 aa  553  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  46.67 
 
 		 591 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  46.35 
 
 		 594 aa  534  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  45.49 
 
 		 593 aa  529  1e-149  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  45.5 
 
 		 594 aa  529  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  45.25 
 
 		 593 aa  525  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  47.19 
 
 		 595 aa  520  1e-146  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  44.61 
 
 		 524 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  44.01 
 
 		 607 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  44.01 
 
 		 607 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  40.73 
 
 		 589 aa  445  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  42.2 
 
 		 591 aa  436  1e-121  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  53.42 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  42.17 
 
 		 589 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  42.83 
 
 		 575 aa  431  1e-119  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.8 
 
 		 575 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.64 
 
 		 587 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  41.71 
 
 		 584 aa  403  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  49.69 
 
 		 1065 aa  325  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  33.74 
 
 		 442 aa  125  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.46 
 
 		 476 aa  124  5e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.34 
 
 		 465 aa  124  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  24.73 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.34 
 
 		 465 aa  124  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  35.37 
 
 		 443 aa  123  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.34 
 
 		 484 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  34.5 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.78 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  30.7 
 
 		 471 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.82 
 
 		 479 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  34.5 
 
 		 427 aa  120  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4737  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.43 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603739  decreased coverage  0.00210198 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  26.63 
 
 		 465 aa  118  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.06 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.97 
 
 		 469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.49 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  27.3 
 
 		 465 aa  117  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  26.84 
 
 		 465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  27.63 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.64 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.29 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.45 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.57 
 
 		 472 aa  115  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  26.65 
 
 		 476 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.48 
 
 		 467 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.24 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.31 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.43 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  28.83 
 
 		 501 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.5 
 
 		 474 aa  114  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.66 
 
 		 537 aa  114  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  26.87 
 
 		 476 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>