More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2083 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 		 591 aa  1189    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  50.17 
 
 		 590 aa  595  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50.09 
 
 		 592 aa  592  1e-168  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50.59 
 
 		 589 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  50.25 
 
 		 591 aa  576  1.0000000000000001e-163  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  50.6 
 
 		 588 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  48.29 
 
 		 586 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  48.64 
 
 		 592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  48.89 
 
 		 578 aa  568  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  49.66 
 
 		 582 aa  570  1e-161  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  47.53 
 
 		 601 aa  566  1e-160  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  49.06 
 
 		 589 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  47.76 
 
 		 586 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  48.62 
 
 		 590 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  46.76 
 
 		 588 aa  561  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  48.81 
 
 		 591 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  48.81 
 
 		 591 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.8 
 
 		 594 aa  557  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  48.4 
 
 		 586 aa  550  1e-155  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.22 
 
 		 578 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  47.78 
 
 		 582 aa  550  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.36 
 
 		 576 aa  549  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  47.73 
 
 		 586 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  49.48 
 
 		 584 aa  545  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  51.13 
 
 		 582 aa  548  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  47.59 
 
 		 585 aa  546  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  47.37 
 
 		 589 aa  547  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  47.74 
 
 		 587 aa  548  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  48.08 
 
 		 586 aa  544  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  47.73 
 
 		 586 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  47.13 
 
 		 587 aa  539  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  48.21 
 
 		 586 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  47.4 
 
 		 588 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  47.42 
 
 		 578 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  47.75 
 
 		 595 aa  538  9.999999999999999e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.67 
 
 		 588 aa  536  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  47.8 
 
 		 587 aa  538  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.22 
 
 		 569 aa  534  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  45.58 
 
 		 582 aa  530  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  47.77 
 
 		 581 aa  530  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  49.9 
 
 		 588 aa  528  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  50.66 
 
 		 584 aa  525  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  47.78 
 
 		 576 aa  521  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  46.34 
 
 		 591 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  45.7 
 
 		 593 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  45.97 
 
 		 594 aa  504  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  46.14 
 
 		 594 aa  501  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  45.72 
 
 		 593 aa  501  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  48.36 
 
 		 579 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  48.54 
 
 		 579 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  48.19 
 
 		 579 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  46 
 
 		 617 aa  480  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  42.95 
 
 		 618 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  45.77 
 
 		 623 aa  470  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.84 
 
 		 575 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  47.07 
 
 		 578 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  43.34 
 
 		 589 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  42.72 
 
 		 524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  40.48 
 
 		 575 aa  403  1e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  41.63 
 
 		 607 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  41.63 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  42.69 
 
 		 589 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  40.15 
 
 		 584 aa  388  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.8 
 
 		 587 aa  381  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  39.74 
 
 		 591 aa  369  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  46.48 
 
 		 413 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  44.92 
 
 		 1065 aa  272  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  35.63 
 
 		 438 aa  143  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  34.82 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  30.27 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  34.48 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  31.78 
 
 		 436 aa  134  5e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  32.66 
 
 		 442 aa  134  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  33.6 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  32.5 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  29.12 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  34.96 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  33.19 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  29.35 
 
 		 437 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  30.72 
 
 		 437 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  32.3 
 
 		 450 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0183  ATP synthase SpaL  28.17 
 
 		 430 aa  126  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.998687  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  29.12 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  30.58 
 
 		 443 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  30.28 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  32.62 
 
 		 504 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  33.04 
 
 		 440 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  32.74 
 
 		 440 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  34.29 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  31.05 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  30.37 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  31.05 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  29.49 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.25 
 
 		 473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  29.23 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  31.23 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  27.76 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  32.6 
 
 		 468 aa  122  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  31.05 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  28.76 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>