More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0386 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  57.51 
 
 
585 aa  681    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  68.17 
 
 
588 aa  816    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  61.94 
 
 
591 aa  719    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  62.33 
 
 
582 aa  719    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 
578 aa  1184    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.44 
 
 
576 aa  658    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  65.35 
 
 
587 aa  746    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.51 
 
 
569 aa  649    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.61 
 
 
586 aa  642    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.24 
 
 
588 aa  667    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  63.7 
 
 
586 aa  750    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  67.77 
 
 
588 aa  810    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.97 
 
 
589 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  71.72 
 
 
582 aa  842    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  58.82 
 
 
584 aa  697    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  59.14 
 
 
588 aa  658    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  59.76 
 
 
586 aa  698    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  75.09 
 
 
578 aa  917    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  63.87 
 
 
587 aa  749    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  58.18 
 
 
589 aa  690    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  63.87 
 
 
587 aa  744    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  57.02 
 
 
582 aa  674    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  59.35 
 
 
586 aa  691    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  57.41 
 
 
591 aa  681    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  57.41 
 
 
591 aa  680    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  69.04 
 
 
584 aa  820    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  60.03 
 
 
586 aa  695    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  61.46 
 
 
590 aa  712    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  64.99 
 
 
576 aa  785    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  59.69 
 
 
586 aa  692    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.77 
 
 
578 aa  671    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  53.49 
 
 
592 aa  644    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  57.12 
 
 
589 aa  678    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  59.01 
 
 
586 aa  681    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  65.58 
 
 
581 aa  775    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  55.99 
 
 
590 aa  634  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  51.8 
 
 
591 aa  618  1e-176  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  51.11 
 
 
592 aa  617  1e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.15 
 
 
594 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  51.72 
 
 
588 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  50.26 
 
 
601 aa  586  1e-166  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  52.23 
 
 
595 aa  574  1.0000000000000001e-162  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  53.25 
 
 
579 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  53.25 
 
 
579 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  53.43 
 
 
579 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  50.52 
 
 
578 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  48.1 
 
 
582 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  49.82 
 
 
593 aa  555  1e-157  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  48.52 
 
 
623 aa  556  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  48.32 
 
 
617 aa  551  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  49.15 
 
 
618 aa  555  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  48.04 
 
 
594 aa  545  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  48.23 
 
 
593 aa  544  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  47.42 
 
 
591 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  48.05 
 
 
594 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  48.96 
 
 
524 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.71 
 
 
575 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  46.17 
 
 
589 aa  439  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  44.75 
 
 
607 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  44.75 
 
 
607 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  41.59 
 
 
589 aa  428  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  42.99 
 
 
575 aa  424  1e-117  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  40.93 
 
 
584 aa  420  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  53.92 
 
 
413 aa  412  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  43.78 
 
 
591 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.77 
 
 
587 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  46.18 
 
 
1065 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.38 
 
 
471 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  32.1 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.73 
 
 
469 aa  140  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.27 
 
 
480 aa  140  8.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.95 
 
 
473 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.75 
 
 
476 aa  137  4e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  30 
 
 
468 aa  138  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.66 
 
 
473 aa  137  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  28.98 
 
 
470 aa  136  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  30.26 
 
 
443 aa  136  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.21 
 
 
468 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.7 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  34.47 
 
 
427 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.21 
 
 
468 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  34.47 
 
 
438 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.7 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.95 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.95 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.95 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.95 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.7 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.95 
 
 
469 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  30.84 
 
 
474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.7 
 
 
484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  34.34 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  36.36 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.85 
 
 
471 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.71 
 
 
464 aa  134  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.71 
 
 
469 aa  134  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  30 
 
 
468 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  34.43 
 
 
440 aa  133  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.95 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.95 
 
 
465 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>