More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3353 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  60.52 
 
 
582 aa  700    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  100 
 
 
587 aa  1187    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.25 
 
 
589 aa  639    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  63.62 
 
 
581 aa  752    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  64.52 
 
 
588 aa  770    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  63.87 
 
 
578 aa  744    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  80.92 
 
 
586 aa  975    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  59.45 
 
 
586 aa  682    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  56.55 
 
 
585 aa  667    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  58.08 
 
 
586 aa  667    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  64.22 
 
 
582 aa  759    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  57.5 
 
 
584 aa  640    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  56.77 
 
 
588 aa  654    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  60.59 
 
 
590 aa  703    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  64.45 
 
 
578 aa  758    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.25 
 
 
569 aa  652    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  81.43 
 
 
587 aa  984    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  55.86 
 
 
591 aa  661    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  55.86 
 
 
591 aa  661    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  57.12 
 
 
586 aa  662    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  58.08 
 
 
586 aa  669    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  80.37 
 
 
591 aa  951    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  57.04 
 
 
589 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  85.69 
 
 
587 aa  1039    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  57.39 
 
 
586 aa  665    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  60.17 
 
 
576 aa  716    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  56.83 
 
 
590 aa  639    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  65.92 
 
 
588 aa  790    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.46 
 
 
589 aa  644    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  64.22 
 
 
584 aa  739    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.48 
 
 
588 aa  633  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.9 
 
 
576 aa  631  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  53.71 
 
 
582 aa  626  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.32 
 
 
592 aa  624  1e-177  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  55.62 
 
 
588 aa  621  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.25 
 
 
586 aa  620  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.4 
 
 
578 aa  621  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  50.6 
 
 
591 aa  609  1e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  52.83 
 
 
592 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.5 
 
 
582 aa  568  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  53.08 
 
 
579 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  52.99 
 
 
579 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  50.6 
 
 
618 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  52.21 
 
 
617 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  47.08 
 
 
595 aa  561  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  52.81 
 
 
579 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  48.19 
 
 
601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  47.69 
 
 
594 aa  560  1e-158  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.55 
 
 
594 aa  558  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  46.94 
 
 
593 aa  560  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  51.37 
 
 
578 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  46.09 
 
 
593 aa  555  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  45.42 
 
 
594 aa  543  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  47.13 
 
 
591 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  49.46 
 
 
623 aa  524  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  48.36 
 
 
524 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.15 
 
 
575 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  44.33 
 
 
607 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  44.33 
 
 
607 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  52.41 
 
 
413 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  42.4 
 
 
591 aa  411  1e-113  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  42.21 
 
 
575 aa  412  1e-113  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  41.13 
 
 
589 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.98 
 
 
587 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  38.4 
 
 
584 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  41.88 
 
 
589 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  49.51 
 
 
1065 aa  305  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  34.08 
 
 
443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  36.56 
 
 
427 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  36.56 
 
 
438 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.7 
 
 
465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.7 
 
 
465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.7 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.88 
 
 
484 aa  134  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.88 
 
 
465 aa  134  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  34.55 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  34.65 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  30.72 
 
 
439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.66 
 
 
459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.57 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  34.4 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  30.42 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.34 
 
 
480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  28.86 
 
 
504 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.48 
 
 
476 aa  131  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  33.46 
 
 
440 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2587  ATP synthase F1, beta subunit  28.93 
 
 
458 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282932  normal  0.0250722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.07 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  30.11 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.08 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.57 
 
 
465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.7 
 
 
486 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.13 
 
 
472 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  31.66 
 
 
440 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  32.51 
 
 
439 aa  127  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.2 
 
 
476 aa  127  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.49 
 
 
476 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  29.38 
 
 
462 aa  127  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.49 
 
 
476 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.28 
 
 
476 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>