More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1763 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.31 
 
 		 486 aa  690    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  73.44 
 
 		 482 aa  706    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  74.64 
 
 		 480 aa  720    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  73.94 
 
 		 477 aa  705    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.96 
 
 		 493 aa  794    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  83.3 
 
 		 493 aa  806    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.08 
 
 		 485 aa  737    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  74.95 
 
 		 478 aa  711    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.26 
 
 		 480 aa  729    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  74.17 
 
 		 476 aa  721    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  73.77 
 
 		 495 aa  734    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.23 
 
 		 475 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.95 
 
 		 486 aa  734    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  67.96 
 
 		 471 aa  634    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  72.06 
 
 		 477 aa  713    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  75 
 
 		 479 aa  706    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.81 
 
 		 476 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  70.87 
 
 		 481 aa  689    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.44 
 
 		 517 aa  689    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.82 
 
 		 491 aa  788    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  77.28 
 
 		 495 aa  741    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.63 
 
 		 484 aa  786    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  79.14 
 
 		 493 aa  787    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.44 
 
 		 509 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  73.28 
 
 		 475 aa  687    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.43 
 
 		 479 aa  709    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.53 
 
 		 478 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.94 
 
 		 485 aa  751    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  76 
 
 		 490 aa  736    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.99 
 
 		 486 aa  812    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.84 
 
 		 484 aa  786    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  77.31 
 
 		 479 aa  766    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.61 
 
 		 486 aa  832    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.05 
 
 		 490 aa  724    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  71.37 
 
 		 482 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  73.43 
 
 		 472 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 484 aa  983    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  80.37 
 
 		 493 aa  797    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.44 
 
 		 509 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 468 aa  624  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 468 aa  624  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.88 
 
 		 473 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.08 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.3 
 
 		 468 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.87 
 
 		 473 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.59 
 
 		 470 aa  618  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.94 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.59 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.59 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.3 
 
 		 462 aa  614  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  64.22 
 
 		 465 aa  610  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.22 
 
 		 465 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.22 
 
 		 465 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  64.66 
 
 		 464 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.37 
 
 		 475 aa  607  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.64 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.96 
 
 		 472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.81 
 
 		 467 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.29 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 465 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.95 
 
 		 468 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.95 
 
 		 468 aa  596  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.96 
 
 		 475 aa  595  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.96 
 
 		 480 aa  597  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  63.77 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  61.36 
 
 		 487 aa  592  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  63.52 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.54 
 
 		 470 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.24 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.11 
 
 		 471 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  62.68 
 
 		 547 aa  585  1e-166  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  62.83 
 
 		 470 aa  586  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.11 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.66 
 
 		 470 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.66 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.58 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.38 
 
 		 474 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.58 
 
 		 459 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.58 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  63.04 
 
 		 471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  61.17 
 
 		 479 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4194  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.07 
 
 		 460 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.821346  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.85 
 
 		 470 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.58 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.58 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.58 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.04 
 
 		 463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.58 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.37 
 
 		 513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.58 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4257  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.07 
 
 		 460 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.12 
 
 		 466 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.33 
 
 		 471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.33 
 
 		 471 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>