More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18200 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  77.14 
 
 
493 aa  771    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  80.34 
 
 
493 aa  784    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.54 
 
 
479 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.8 
 
 
485 aa  751    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.78 
 
 
485 aa  724    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.06 
 
 
475 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  73.61 
 
 
482 aa  711    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  75 
 
 
477 aa  702    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.73 
 
 
486 aa  679    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  68.45 
 
 
471 aa  635    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.46 
 
 
491 aa  765    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
486 aa  987    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.18 
 
 
480 aa  720    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  72.41 
 
 
472 aa  674    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.47 
 
 
509 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  76.37 
 
 
476 aa  738    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  79.32 
 
 
479 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.32 
 
 
478 aa  708    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  78.39 
 
 
493 aa  763    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.26 
 
 
517 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.16 
 
 
486 aa  750    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.73 
 
 
493 aa  770    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.61 
 
 
484 aa  832    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.97 
 
 
486 aa  781    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  75.05 
 
 
495 aa  721    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.18 
 
 
479 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.3 
 
 
476 aa  685    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  72.5 
 
 
482 aa  698    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  76.23 
 
 
478 aa  721    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.42 
 
 
484 aa  757    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.47 
 
 
509 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.3 
 
 
490 aa  706    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  75.37 
 
 
495 aa  723    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  74.89 
 
 
475 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  73.63 
 
 
477 aa  730    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.78 
 
 
484 aa  753    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  74.09 
 
 
481 aa  701    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.36 
 
 
490 aa  733    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  75.22 
 
 
480 aa  710    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 
473 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.38 
 
 
470 aa  614  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 
468 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.52 
 
 
468 aa  617  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.3 
 
 
468 aa  616  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 
469 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 
468 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.45 
 
 
473 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 
469 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 
469 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 
469 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 
469 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 
469 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.38 
 
 
470 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.3 
 
 
464 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.38 
 
 
470 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.44 
 
 
462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  63.79 
 
 
465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.01 
 
 
465 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.01 
 
 
465 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.09 
 
 
468 aa  600  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  63.58 
 
 
467 aa  596  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.09 
 
 
469 aa  597  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.3 
 
 
468 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.3 
 
 
468 aa  591  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.97 
 
 
475 aa  592  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.73 
 
 
470 aa  589  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.52 
 
 
470 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.52 
 
 
465 aa  589  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.73 
 
 
470 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.8 
 
 
472 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.97 
 
 
467 aa  589  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  62.5 
 
 
464 aa  588  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.23 
 
 
470 aa  588  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  61.88 
 
 
482 aa  588  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.38 
 
 
480 aa  591  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.23 
 
 
470 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.1 
 
 
468 aa  587  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.88 
 
 
471 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.98 
 
 
474 aa  584  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.96 
 
 
475 aa  585  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.88 
 
 
482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  62.72 
 
 
470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.58 
 
 
459 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.03 
 
 
513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  61.41 
 
 
471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  61.41 
 
 
470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  60.62 
 
 
487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.44 
 
 
471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.44 
 
 
471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  63.36 
 
 
459 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.07 
 
 
458 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.36 
 
 
459 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5730  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.15 
 
 
458 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.37 
 
 
482 aa  578  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.29 
 
 
481 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.58 
 
 
462 aa  580  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  63.12 
 
 
485 aa  578  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.42 
 
 
474 aa  581  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.15 
 
 
458 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.15 
 
 
458 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>