More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2126 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.62 
 
 
517 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.52 
 
 
479 aa  681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.43 
 
 
486 aa  688    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  79.23 
 
 
477 aa  756    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  72.14 
 
 
493 aa  671    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.06 
 
 
476 aa  748    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  71.46 
 
 
493 aa  683    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.29 
 
 
480 aa  717    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.63 
 
 
485 aa  686    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  72.51 
 
 
493 aa  673    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  71.97 
 
 
477 aa  697    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  71.37 
 
 
479 aa  673    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.51 
 
 
486 aa  740    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  73.15 
 
 
475 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.19 
 
 
490 aa  680    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.52 
 
 
493 aa  686    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.59 
 
 
479 aa  680    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  73.22 
 
 
482 aa  697    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  80 
 
 
478 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  70.28 
 
 
495 aa  644    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 
472 aa  959    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.4 
 
 
484 aa  703    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.84 
 
 
509 aa  744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.22 
 
 
491 aa  674    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  77.07 
 
 
482 aa  743    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  72.01 
 
 
495 aa  669    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.5 
 
 
485 aa  728    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  76.63 
 
 
478 aa  728    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.74 
 
 
484 aa  703    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.41 
 
 
486 aa  674    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.28 
 
 
486 aa  726    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.01 
 
 
490 aa  708    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  75.91 
 
 
476 aa  721    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  78.96 
 
 
481 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  75.81 
 
 
480 aa  716    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.43 
 
 
484 aa  682    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.84 
 
 
509 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.74 
 
 
475 aa  742    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  67.16 
 
 
471 aa  628  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
468 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
469 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
469 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
469 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.09 
 
 
468 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
469 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
469 aa  624  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
468 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 
469 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.87 
 
 
468 aa  624  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.61 
 
 
472 aa  621  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 
464 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
470 aa  618  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
473 aa  618  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
473 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
470 aa  617  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
470 aa  617  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 
469 aa  616  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.17 
 
 
468 aa  617  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 
465 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 
465 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 
465 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.02 
 
 
466 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.38 
 
 
475 aa  599  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  64.57 
 
 
467 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  63 
 
 
475 aa  598  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  63.64 
 
 
464 aa  599  1e-170  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.85 
 
 
462 aa  598  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.87 
 
 
480 aa  600  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.29 
 
 
462 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.85 
 
 
462 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  62.55 
 
 
471 aa  597  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 
468 aa  593  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.08 
 
 
482 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.82 
 
 
476 aa  589  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  61.28 
 
 
487 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.77 
 
 
482 aa  588  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.42 
 
 
462 aa  588  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.42 
 
 
462 aa  588  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.67 
 
 
474 aa  591  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.85 
 
 
513 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  63.04 
 
 
465 aa  587  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.34 
 
 
503 aa  586  1e-166  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.01 
 
 
468 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.01 
 
 
468 aa  585  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.17 
 
 
471 aa  585  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  61.67 
 
 
482 aa  585  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.52 
 
 
476 aa  588  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  63 
 
 
481 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.38 
 
 
470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 
475 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.46 
 
 
467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 
475 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.12 
 
 
462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.6 
 
 
470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.2 
 
 
462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  62.12 
 
 
470 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.53 
 
 
464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.9 
 
 
484 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.42 
 
 
465 aa  580  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.43 
 
 
507 aa  580  1e-164  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>