More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1024 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.25 
 
 		 490 aa  662    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  75.21 
 
 		 475 aa  712    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  69.44 
 
 		 482 aa  675    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.2 
 
 		 486 aa  711    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  69.1 
 
 		 495 aa  645    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  77.97 
 
 		 476 aa  743    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.32 
 
 		 478 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.24 
 
 		 485 aa  665    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.68 
 
 		 484 aa  684    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.38 
 
 		 480 aa  714    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 		 476 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.43 
 
 		 484 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.54 
 
 		 486 aa  714    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  72.52 
 
 		 472 aa  681    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.39 
 
 		 517 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  76.31 
 
 		 482 aa  744    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.68 
 
 		 465 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.01 
 
 		 493 aa  692    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.97 
 
 		 462 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  72.86 
 
 		 493 aa  696    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  95.41 
 
 		 479 aa  926    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  74.07 
 
 		 479 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  71.65 
 
 		 481 aa  665    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  72.05 
 
 		 493 aa  698    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 479 aa  969    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  71 
 
 		 475 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  70.25 
 
 		 495 aa  670    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.7 
 
 		 486 aa  687    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 		 509 aa  668    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  70.81 
 
 		 493 aa  682    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  75.32 
 
 		 480 aa  700    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.6 
 
 		 509 aa  668    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.99 
 
 		 485 aa  707    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.84 
 
 		 491 aa  693    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  71.03 
 
 		 477 aa  687    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.5 
 
 		 486 aa  668    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  74.17 
 
 		 478 aa  712    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.9 
 
 		 484 aa  683    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  69.55 
 
 		 471 aa  648    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.03 
 
 		 490 aa  762    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  71.24 
 
 		 477 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 465 aa  631  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 465 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.17 
 
 		 470 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 		 470 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.45 
 
 		 472 aa  628  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 468 aa  629  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 468 aa  628  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 467 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 470 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 470 aa  624  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.17 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.17 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.66 
 
 		 468 aa  621  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.16 
 
 		 469 aa  621  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.87 
 
 		 468 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.27 
 
 		 475 aa  622  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.23 
 
 		 462 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  64.78 
 
 		 487 aa  619  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.09 
 
 		 473 aa  618  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 		 473 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.6 
 
 		 474 aa  615  1e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  66.88 
 
 		 465 aa  614  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.96 
 
 		 481 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  66.02 
 
 		 467 aa  614  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  64.38 
 
 		 482 aa  614  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 513 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.3 
 
 		 470 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.02 
 
 		 464 aa  609  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.14 
 
 		 493 aa  608  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.57 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  64.94 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  65.37 
 
 		 470 aa  609  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.5 
 
 		 467 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.94 
 
 		 462 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.17 
 
 		 482 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.91 
 
 		 470 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.4 
 
 		 481 aa  606  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.47 
 
 		 471 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  63.4 
 
 		 470 aa  607  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.77 
 
 		 476 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.73 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.5 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.07 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  66.02 
 
 		 503 aa  604  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.05 
 
 		 473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.78 
 
 		 472 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.52 
 
 		 472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.47 
 
 		 478 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>