More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2407 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  73.75 
 
 		 482 aa  706    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.67 
 
 		 491 aa  724    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.59 
 
 		 476 aa  694    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  71.49 
 
 		 477 aa  688    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  73.96 
 
 		 479 aa  713    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  76.87 
 
 		 477 aa  717    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 480 aa  974    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.27 
 
 		 517 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.08 
 
 		 484 aa  770    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  72.95 
 
 		 493 aa  709    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.43 
 
 		 485 aa  737    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  78.12 
 
 		 476 aa  763    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  90.19 
 
 		 480 aa  869    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.18 
 
 		 486 aa  720    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.79 
 
 		 479 aa  718    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  75.65 
 
 		 493 aa  707    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.67 
 
 		 486 aa  701    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  78.54 
 
 		 475 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  76.29 
 
 		 472 aa  717    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  76.62 
 
 		 481 aa  710    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  79.33 
 
 		 482 aa  775    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.48 
 
 		 509 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  76.6 
 
 		 478 aa  716    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.22 
 
 		 486 aa  719    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.38 
 
 		 479 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.43 
 
 		 485 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.16 
 
 		 493 aa  715    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  72.59 
 
 		 495 aa  696    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.67 
 
 		 484 aa  765    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.79 
 
 		 478 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.84 
 
 		 490 aa  747    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  74.21 
 
 		 493 aa  709    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.26 
 
 		 484 aa  729    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  72.56 
 
 		 495 aa  693    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.48 
 
 		 509 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.48 
 
 		 486 aa  724    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.01 
 
 		 475 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.92 
 
 		 490 aa  694    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  69.03 
 
 		 471 aa  631  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 473 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 473 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 464 aa  619  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 		 468 aa  616  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 		 468 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.45 
 
 		 469 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.45 
 
 		 469 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  65.06 
 
 		 487 aa  611  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 465 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  64.04 
 
 		 471 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 475 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.45 
 
 		 470 aa  598  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.93 
 
 		 470 aa  598  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.64 
 
 		 472 aa  598  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 		 468 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 		 468 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.47 
 
 		 504 aa  599  1e-170  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.15 
 
 		 476 aa  600  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  65.37 
 
 		 467 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 		 471 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 		 471 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.5 
 
 		 467 aa  595  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.22 
 
 		 467 aa  596  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.3 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.21 
 
 		 475 aa  596  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.38 
 
 		 482 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.24 
 
 		 470 aa  596  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.93 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.93 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.15 
 
 		 465 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.73 
 
 		 468 aa  594  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.02 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  63.75 
 
 		 482 aa  592  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.52 
 
 		 470 aa  594  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.09 
 
 		 470 aa  594  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.15 
 
 		 513 aa  591  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.93 
 
 		 465 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.54 
 
 		 481 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  65.24 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.09 
 
 		 469 aa  591  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.87 
 
 		 480 aa  592  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  65.01 
 
 		 465 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.61 
 
 		 474 aa  593  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  64.58 
 
 		 464 aa  590  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.73 
 
 		 472 aa  589  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.29 
 
 		 475 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 		 462 aa  588  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.29 
 
 		 475 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.58 
 
 		 470 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.15 
 
 		 471 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.09 
 
 		 478 aa  589  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.09 
 
 		 476 aa  591  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.6 
 
 		 493 aa  588  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.73 
 
 		 466 aa  591  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>