More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1072 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  68.63 
 
 
471 aa  636    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.12 
 
 
491 aa  860    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  72.48 
 
 
477 aa  694    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  71.55 
 
 
475 aa  674    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.53 
 
 
484 aa  768    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.27 
 
 
480 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.39 
 
 
486 aa  678    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.09 
 
 
490 aa  774    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.16 
 
 
478 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.67 
 
 
476 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  89.86 
 
 
493 aa  904    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  72.03 
 
 
481 aa  679    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.69 
 
 
485 aa  739    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  71.28 
 
 
472 aa  676    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  88.84 
 
 
493 aa  894    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  89.84 
 
 
493 aa  897    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  73.36 
 
 
482 aa  687    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.29 
 
 
479 aa  712    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.1 
 
 
517 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  73.01 
 
 
479 aa  724    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  75.16 
 
 
480 aa  709    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.84 
 
 
486 aa  811    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.8 
 
 
485 aa  733    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.05 
 
 
479 aa  705    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.1 
 
 
509 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  73.68 
 
 
478 aa  702    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.34 
 
 
486 aa  785    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  78.9 
 
 
495 aa  754    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  72.8 
 
 
477 aa  714    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 
493 aa  996    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.8 
 
 
486 aa  734    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.51 
 
 
484 aa  754    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  79.87 
 
 
495 aa  782    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.49 
 
 
490 aa  738    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  82 
 
 
484 aa  811    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  70.84 
 
 
482 aa  679    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.1 
 
 
509 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.24 
 
 
475 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  72.88 
 
 
476 aa  703    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
468 aa  628  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
468 aa  628  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
468 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
468 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 
469 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 
473 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
469 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
469 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
469 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 
469 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
464 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.97 
 
 
473 aa  624  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 
470 aa  622  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
470 aa  622  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
469 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
470 aa  622  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.09 
 
 
468 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  66.45 
 
 
467 aa  611  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.51 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.68 
 
 
475 aa  604  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.56 
 
 
472 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.41 
 
 
465 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 
465 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.87 
 
 
469 aa  600  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.92 
 
 
475 aa  597  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.42 
 
 
465 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.97 
 
 
468 aa  593  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  63.5 
 
 
465 aa  588  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.08 
 
 
467 aa  591  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.33 
 
 
468 aa  590  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.33 
 
 
468 aa  590  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.29 
 
 
480 aa  588  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 
466 aa  590  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  61.95 
 
 
487 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  62.53 
 
 
470 aa  585  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  62.24 
 
 
485 aa  582  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.66 
 
 
482 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.21 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  61.44 
 
 
471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.74 
 
 
513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  62.69 
 
 
464 aa  580  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.69 
 
 
470 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  62.69 
 
 
470 aa  578  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.91 
 
 
470 aa  578  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  60.04 
 
 
482 aa  579  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.42 
 
 
504 aa  578  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.49 
 
 
471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.91 
 
 
470 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.83 
 
 
471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  61.81 
 
 
479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.69 
 
 
470 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.83 
 
 
471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.83 
 
 
471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.39 
 
 
465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.91 
 
 
462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.39 
 
 
465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.72 
 
 
472 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.37 
 
 
470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.74 
 
 
467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.39 
 
 
458 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.34 
 
 
463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>