More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4136 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  74.79 
 
 		 477 aa  720    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.95 
 
 		 486 aa  707    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 		 468 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  76.21 
 
 		 477 aa  734    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.66 
 
 		 485 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 469 aa  634    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 469 aa  634    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 469 aa  634    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  80.77 
 
 		 476 aa  778    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  70.97 
 
 		 495 aa  660    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.95 
 
 		 476 aa  731    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.6 
 
 		 480 aa  716    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.17 
 
 		 479 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  78.92 
 
 		 475 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  74.53 
 
 		 482 aa  728    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  72.52 
 
 		 495 aa  684    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 		 478 aa  972    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  80 
 
 		 478 aa  759    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 469 aa  634    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.05 
 
 		 517 aa  730    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.26 
 
 		 509 aa  732    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.81 
 
 		 493 aa  701    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  75 
 
 		 479 aa  717    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 		 490 aa  681    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.63 
 
 		 491 aa  709    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  77.01 
 
 		 481 aa  729    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.32 
 
 		 486 aa  731    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.68 
 
 		 486 aa  746    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  73 
 
 		 485 aa  689    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  72.37 
 
 		 493 aa  701    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 		 468 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.26 
 
 		 509 aa  732    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 		 468 aa  636    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 		 468 aa  638    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.74 
 
 		 475 aa  730    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  76.46 
 
 		 482 aa  740    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  74.1 
 
 		 493 aa  701    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 		 464 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.23 
 
 		 486 aa  721    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  75.31 
 
 		 479 aa  736    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  74.73 
 
 		 493 aa  707    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.49 
 
 		 484 aa  690    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  75.81 
 
 		 480 aa  716    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  76.63 
 
 		 472 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.5 
 
 		 490 aa  753    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.49 
 
 		 484 aa  693    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.95 
 
 		 484 aa  711    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 		 473 aa  631  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 473 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 470 aa  628  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  68.47 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 462 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.45 
 
 		 465 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 470 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 470 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.92 
 
 		 475 aa  617  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.45 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 		 480 aa  614  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.1 
 
 		 470 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.44 
 
 		 467 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.1 
 
 		 470 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.58 
 
 		 465 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.58 
 
 		 465 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.1 
 
 		 470 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.45 
 
 		 470 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  65.73 
 
 		 467 aa  608  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 		 475 aa  608  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.45 
 
 		 470 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.88 
 
 		 468 aa  610  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.24 
 
 		 469 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.79 
 
 		 458 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.01 
 
 		 458 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.32 
 
 		 471 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.32 
 
 		 471 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.5 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.52 
 
 		 459 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.89 
 
 		 468 aa  598  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  63.79 
 
 		 459 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.79 
 
 		 459 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  62.96 
 
 		 471 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.52 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.58 
 
 		 458 aa  598  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 		 479 aa  598  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  61.36 
 
 		 487 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  63.28 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4196  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.07 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4146  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.07 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.85 
 
 		 475 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4075  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.07 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.999659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.85 
 
 		 458 aa  594  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4189  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.28 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.03 
 
 		 481 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.89 
 
 		 466 aa  595  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.28 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>