More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.47 
 
 
486 aa  709    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  74.06 
 
 
482 aa  701    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  79.23 
 
 
472 aa  756    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  71.91 
 
 
479 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  100 
 
 
477 aa  964    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  70.02 
 
 
495 aa  648    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.13 
 
 
486 aa  800    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.87 
 
 
480 aa  717    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  73.77 
 
 
493 aa  690    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  77.68 
 
 
480 aa  722    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  70.79 
 
 
495 aa  667    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  74.42 
 
 
475 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.68 
 
 
485 aa  710    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  80.17 
 
 
481 aa  768    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  76.21 
 
 
478 aa  734    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  76.08 
 
 
477 aa  719    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.01 
 
 
490 aa  673    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.53 
 
 
479 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.92 
 
 
476 aa  798    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.21 
 
 
478 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.73 
 
 
486 aa  736    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  73.1 
 
 
493 aa  706    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.24 
 
 
479 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  72.5 
 
 
493 aa  692    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.97 
 
 
509 aa  798    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.52 
 
 
493 aa  705    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.74 
 
 
491 aa  715    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  78.63 
 
 
482 aa  771    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.33 
 
 
485 aa  736    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.09 
 
 
484 aa  713    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.97 
 
 
517 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  75 
 
 
486 aa  702    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.5 
 
 
484 aa  706    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  76.63 
 
 
476 aa  734    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.31 
 
 
490 aa  711    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.94 
 
 
484 aa  705    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.97 
 
 
509 aa  798    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.03 
 
 
475 aa  799    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  68.47 
 
 
471 aa  632  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.16 
 
 
468 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 
464 aa  617  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.16 
 
 
468 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.17 
 
 
473 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
473 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
468 aa  615  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 
468 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.95 
 
 
468 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.88 
 
 
469 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.02 
 
 
469 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.02 
 
 
469 aa  611  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.02 
 
 
469 aa  611  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
469 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.02 
 
 
469 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 
469 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 
470 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.23 
 
 
470 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.01 
 
 
470 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.14 
 
 
472 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  64.29 
 
 
467 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.59 
 
 
475 aa  599  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.58 
 
 
462 aa  598  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.16 
 
 
480 aa  600  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  64.16 
 
 
465 aa  598  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 
465 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.58 
 
 
513 aa  593  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.58 
 
 
466 aa  594  1e-168  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  63.3 
 
 
464 aa  594  1e-168  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.52 
 
 
467 aa  589  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  64.4 
 
 
471 aa  590  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 
468 aa  587  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.14 
 
 
475 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.7 
 
 
465 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.7 
 
 
465 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.85 
 
 
468 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.85 
 
 
468 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.42 
 
 
471 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  61.55 
 
 
487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.17 
 
 
504 aa  581  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.07 
 
 
458 aa  579  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.28 
 
 
465 aa  580  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.07 
 
 
470 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.18 
 
 
481 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.29 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.72 
 
 
484 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.64 
 
 
465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.29 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.5 
 
 
482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.07 
 
 
470 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.85 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.07 
 
 
470 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  62.08 
 
 
482 aa  575  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.98 
 
 
465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.42 
 
 
471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.64 
 
 
471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.2 
 
 
484 aa  574  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.92 
 
 
483 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  62.02 
 
 
503 aa  572  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.92 
 
 
483 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  61.95 
 
 
470 aa  574  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  61.89 
 
 
481 aa  571  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>