More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2448 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  77.96 
 
 		 495 aa  779    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1123  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.75 
 
 		 490 aa  766    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  73.77 
 
 		 480 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  88.21 
 
 		 493 aa  887    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 		 486 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  70.47 
 
 		 482 aa  681    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.1 
 
 		 491 aa  854    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.95 
 
 		 480 aa  709    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  72.8 
 
 		 479 aa  718    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.07 
 
 		 509 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  88.21 
 
 		 493 aa  894    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  72.19 
 
 		 477 aa  696    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08180  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.47 
 
 		 485 aa  733    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 		 493 aa  999    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0900  ATP synthase F1 subunit beta  73.54 
 
 		 482 aa  685    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1255  ATP synthase F1, beta subunit  70.9 
 
 		 481 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.184637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6136  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.76 
 
 		 478 aa  683    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  91.19 
 
 		 493 aa  886    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1671  H(+)-transporting two-sector ATPase  72.8 
 
 		 475 aa  690    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  72.37 
 
 		 478 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3707  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.05 
 
 		 479 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.601843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.07 
 
 		 517 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.12 
 
 		 484 aa  763    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.89 
 
 		 475 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29550  ATP synthase, F1 beta subunit  72.5 
 
 		 477 aa  692    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.14 
 
 		 484 aa  787    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.39 
 
 		 486 aa  763    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  78.74 
 
 		 495 aa  761    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1024  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.81 
 
 		 479 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.64 
 
 		 485 aa  730    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.07 
 
 		 509 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  72.14 
 
 		 472 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.85 
 
 		 486 aa  731    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2318  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.67 
 
 		 476 aa  671    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.651869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  73.98 
 
 		 476 aa  701    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.1 
 
 		 484 aa  751    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.22 
 
 		 486 aa  816    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.06 
 
 		 490 aa  724    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 468 aa  628  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 468 aa  628  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 468 aa  628  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  67.23 
 
 		 471 aa  626  1e-178  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 468 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 464 aa  623  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.1 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 462 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.01 
 
 		 472 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.36 
 
 		 470 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  65.37 
 
 		 467 aa  607  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 		 470 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 		 470 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.63 
 
 		 475 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.93 
 
 		 465 aa  594  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.71 
 
 		 475 aa  594  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.93 
 
 		 465 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.22 
 
 		 469 aa  592  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.77 
 
 		 467 aa  591  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.07 
 
 		 468 aa  588  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  62.21 
 
 		 482 aa  591  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  62.5 
 
 		 465 aa  588  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  62 
 
 		 482 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.9 
 
 		 468 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.9 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.26 
 
 		 459 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.69 
 
 		 482 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.65 
 
 		 470 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.34 
 
 		 480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.28 
 
 		 466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.56 
 
 		 470 aa  581  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.64 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  60.72 
 
 		 547 aa  578  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.47 
 
 		 458 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.12 
 
 		 462 aa  579  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.47 
 
 		 471 aa  579  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.77 
 
 		 470 aa  581  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  60.59 
 
 		 471 aa  578  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.83 
 
 		 470 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.12 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  60.91 
 
 		 487 aa  581  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  62.47 
 
 		 459 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.47 
 
 		 459 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.36 
 
 		 472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.92 
 
 		 483 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.34 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.12 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.69 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.45 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  62.26 
 
 		 464 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.15 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.99 
 
 		 471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.83 
 
 		 471 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>