More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4257 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0480  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.6 
 
 
471 aa  754    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  96.3 
 
 
460 aa  907    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  96.3 
 
 
460 aa  907    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 
464 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.55 
 
 
470 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.48 
 
 
458 aa  782    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.43 
 
 
464 aa  751    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.91 
 
 
460 aa  801    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.91 
 
 
458 aa  798    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3317  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.4 
 
 
467 aa  755    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.0243325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.98 
 
 
463 aa  817    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0062  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.25 
 
 
461 aa  807    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
465 aa  657    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.12 
 
 
471 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.8 
 
 
521 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.77 
 
 
463 aa  817    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  82.83 
 
 
459 aa  786    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.43 
 
 
464 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.97 
 
 
458 aa  804    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
465 aa  657    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.47 
 
 
466 aa  756    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.43 
 
 
464 aa  751    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.78 
 
 
458 aa  800    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.78 
 
 
458 aa  800    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.65 
 
 
459 aa  752    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.83 
 
 
459 aa  787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.85 
 
 
477 aa  744    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4114  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.4 
 
 
466 aa  750    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.181857  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3346  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.61 
 
 
467 aa  764    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0372  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.03 
 
 
476 aa  757    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.678758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.35 
 
 
459 aa  747    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 
476 aa  641    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2528  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.44 
 
 
467 aa  769    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.43 
 
 
464 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.65 
 
 
458 aa  807    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5730  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.13 
 
 
458 aa  796    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.28 
 
 
475 aa  660    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.31 
 
 
468 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.31 
 
 
468 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.65 
 
 
464 aa  753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 
482 aa  655    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.68 
 
 
462 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.9 
 
 
470 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 
464 aa  638    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2165  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.24 
 
 
459 aa  727    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  68.44 
 
 
530 aa  642    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.34 
 
 
471 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.83 
 
 
459 aa  767    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.15 
 
 
476 aa  642    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.09 
 
 
474 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 
462 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.43 
 
 
464 aa  751    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.79 
 
 
537 aa  646    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.16 
 
 
474 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
476 aa  646    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.86 
 
 
481 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.9 
 
 
462 aa  808    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3730  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.16 
 
 
465 aa  751    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.59 
 
 
474 aa  651    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.17 
 
 
474 aa  754    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3966  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.39 
 
 
470 aa  749    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000531769  normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
476 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.74 
 
 
465 aa  755    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0327  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.4 
 
 
467 aa  740    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.713422  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.87 
 
 
464 aa  753    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.68 
 
 
463 aa  809    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
476 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.84 
 
 
458 aa  794    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 
476 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2327  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.85 
 
 
477 aa  739    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.568138  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3494  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.26 
 
 
467 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000137861  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0141  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.99 
 
 
457 aa  800    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.773497  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.05 
 
 
462 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 
474 aa  643    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.43 
 
 
464 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.43 
 
 
464 aa  750    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.87 
 
 
464 aa  773    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.12 
 
 
461 aa  818    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 
519 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  95.87 
 
 
460 aa  904    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.85 
 
 
475 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  90 
 
 
457 aa  852    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.04 
 
 
471 aa  751    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.55 
 
 
463 aa  816    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.55 
 
 
463 aa  816    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.04 
 
 
458 aa  788    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.12 
 
 
463 aa  810    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.1 
 
 
464 aa  646    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.98 
 
 
470 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.43 
 
 
464 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  85 
 
 
458 aa  805    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.88 
 
 
474 aa  735    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.78 
 
 
458 aa  801    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.98 
 
 
463 aa  813    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.39 
 
 
468 aa  750    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.43 
 
 
464 aa  750    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.43 
 
 
464 aa  751    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.28 
 
 
475 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.77 
 
 
463 aa  817    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.67 
 
 
465 aa  645    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>