More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1068 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1068  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 782 aa  1594    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219806  normal  0.42759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1895  peptidoglycan glycosyltransferase  49.6 
 
 		 819 aa  579  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.288802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2706  glycosyl transferase family 51  41.84 
 
 		 728 aa  501  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488127  normal  0.218116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1642  family 51 glycosyl transferase  40.24 
 
 		 748 aa  437  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000308758  normal  0.607604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  33.65 
 
 		 905 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  32.28 
 
 		 640 aa  292  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.07 
 
 		 640 aa  292  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  31.97 
 
 		 829 aa  290  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.29 
 
 		 761 aa  287  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  32.41 
 
 		 828 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.97 
 
 		 643 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.87 
 
 		 648 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.62 
 
 		 643 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.62 
 
 		 643 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  33.23 
 
 		 654 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.25 
 
 		 618 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.01 
 
 		 661 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.16 
 
 		 765 aa  279  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  33.44 
 
 		 656 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.01 
 
 		 667 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  32.89 
 
 		 701 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  32.53 
 
 		 693 aa  273  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.09 
 
 		 806 aa  272  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  32.06 
 
 		 744 aa  270  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  32.03 
 
 		 704 aa  264  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  32.05 
 
 		 751 aa  264  6e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  33.53 
 
 		 861 aa  262  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  31.57 
 
 		 662 aa  260  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.23 
 
 		 649 aa  258  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 801 aa  257  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  28.89 
 
 		 814 aa  254  6e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  29.4 
 
 		 820 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  31.76 
 
 		 723 aa  251  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  32.75 
 
 		 855 aa  251  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  33.58 
 
 		 853 aa  250  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 830 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  31.15 
 
 		 708 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  30.11 
 
 		 648 aa  247  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.18 
 
 		 646 aa  246  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  31.02 
 
 		 683 aa  246  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  31.02 
 
 		 683 aa  246  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  30.14 
 
 		 727 aa  246  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  31.02 
 
 		 683 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  33.44 
 
 		 757 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  32.22 
 
 		 732 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  30.72 
 
 		 683 aa  245  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  30.87 
 
 		 683 aa  245  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  30.87 
 
 		 683 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 683 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 683 aa  244  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.12 
 
 		 776 aa  244  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  33.85 
 
 		 770 aa  243  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  34.01 
 
 		 709 aa  243  9e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  30.91 
 
 		 625 aa  243  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  32.66 
 
 		 712 aa  242  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  31.3 
 
 		 710 aa  242  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  32.76 
 
 		 880 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  30.37 
 
 		 676 aa  239  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  31.16 
 
 		 833 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  30.87 
 
 		 683 aa  239  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  33.39 
 
 		 778 aa  239  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  31.55 
 
 		 824 aa  239  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  30.55 
 
 		 683 aa  239  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  31.85 
 
 		 658 aa  238  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  29.53 
 
 		 642 aa  238  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 		 860 aa  236  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  31.54 
 
 		 710 aa  236  9e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  33.51 
 
 		 741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  33.64 
 
 		 726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  32.63 
 
 		 739 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  32.84 
 
 		 748 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  32.68 
 
 		 680 aa  235  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  32.36 
 
 		 734 aa  234  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  32.52 
 
 		 680 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 730 aa  234  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  31.33 
 
 		 763 aa  234  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  28.91 
 
 		 795 aa  233  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  32.35 
 
 		 673 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  32.35 
 
 		 680 aa  233  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  32.35 
 
 		 673 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  32.52 
 
 		 667 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  31.23 
 
 		 755 aa  233  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  29.13 
 
 		 668 aa  233  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.03 
 
 		 683 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  29.89 
 
 		 705 aa  232  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.34 
 
 		 734 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  32.52 
 
 		 680 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  31.92 
 
 		 980 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.57 
 
 		 727 aa  231  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 952 aa  231  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.52 
 
 		 735 aa  230  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  32.01 
 
 		 722 aa  230  7e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  27.3 
 
 		 642 aa  230  8e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  33.69 
 
 		 680 aa  230  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  30.16 
 
 		 750 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  32.68 
 
 		 679 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  33.51 
 
 		 680 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  31.1 
 
 		 775 aa  229  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  29.07 
 
 		 720 aa  229  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>