More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0735 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
385 aa  768    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  68.51 
 
 
416 aa  505  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0718  Extracellular ligand-binding receptor  66.11 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  61.67 
 
 
390 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0717  Extracellular ligand-binding receptor  60.5 
 
 
413 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726528  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0714  Extracellular ligand-binding receptor  54.48 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2496  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  52.09 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106087  hitchhiker  0.00162568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  36.93 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  38.66 
 
 
386 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  38.66 
 
 
386 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  38.26 
 
 
377 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  37.23 
 
 
378 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  38.34 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  33.04 
 
 
376 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 
392 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.65 
 
 
396 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  32.43 
 
 
384 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  31.19 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  32.32 
 
 
396 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  31.38 
 
 
419 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  30.51 
 
 
395 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  31.8 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.1 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 
374 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  31.42 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.06 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
393 aa  126  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.17 
 
 
395 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
383 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
382 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 
404 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.1 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.89 
 
 
397 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 
369 aa  117  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.78 
 
 
385 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  29 
 
 
402 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  31 
 
 
381 aa  116  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  31.6 
 
 
383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  30.2 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  27.21 
 
 
397 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  27.21 
 
 
397 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 
385 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  28.11 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 
375 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
402 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
381 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
381 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 
372 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.16 
 
 
380 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
381 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 
389 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
378 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.17 
 
 
399 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.37 
 
 
392 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.98 
 
 
395 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.39 
 
 
373 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 
396 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 
396 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 
396 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
379 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
379 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.49 
 
 
381 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 
382 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 
383 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 
383 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
370 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
380 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
373 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
379 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
381 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 
370 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 
377 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 
379 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
373 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
370 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
373 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.01 
 
 
383 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
379 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
378 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2361  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
383 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00517611  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.53 
 
 
391 aa  100  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  24.74 
 
 
374 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
401 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.45 
 
 
402 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 
371 aa  99.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 
383 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  25.98 
 
 
391 aa  99.4  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>