More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5258 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 397 aa  827    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  29.4 
 
 		 371 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3922  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 418 aa  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1635  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.936723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0188  oxidoreductase domain protein  37.55 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3794  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3384  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 		 400 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.471106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4669  oxidoreductase domain protein  29.04 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1753  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000417431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1467  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  30.13 
 
 		 430 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 372 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2802  oxidoreductase domain protein  25.92 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2578  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4171  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.51 
 
 		 495 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  25.29 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  30.1 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  22.29 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  32.93 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  29.85 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  29.85 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.5 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 364 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4113  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.98 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.8 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  30.28 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  29.68 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  21.7 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  26.55 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  26.55 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 		 371 aa  69.7  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  41.35 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  40.38 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.11 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  36.97 
 
 		 349 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  29.03 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.89 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  30.2 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  29.34 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  25.28 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  27.65 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.85 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.85 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.03 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  23.87 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  24.39 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  28 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  26.71 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  31.67 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.95 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>