41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4205 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  100 
 
 		 1386 aa  2739    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  37.35 
 
 		 2278 aa  579  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  37.6 
 
 		 1303 aa  529  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  40.34 
 
 		 1748 aa  172  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  28.49 
 
 		 3737 aa  151  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  28.7 
 
 		 4429 aa  141  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  50.21 
 
 		 1228 aa  140  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  35.11 
 
 		 1160 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  28.24 
 
 		 2005 aa  136  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4548  hypothetical protein  30.55 
 
 		 659 aa  127  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546791  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  32.67 
 
 		 1266 aa  112  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  26.84 
 
 		 3542 aa  107  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1439 aa  106  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1414 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  35.09 
 
 		 1302 aa  105  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1079 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1440 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  36.61 
 
 		 1275 aa  101  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  36.63 
 
 		 691 aa  99.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  31.39 
 
 		 1108 aa  92.8  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  25.51 
 
 		 3793 aa  92.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  29.52 
 
 		 991 aa  80.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 774 aa  75.5  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  38.46 
 
 		 1414 aa  73.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.91 
 
 		 4896 aa  71.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  29.47 
 
 		 1288 aa  70.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.56 
 
 		 1657 aa  67.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 		 1750 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  23.43 
 
 		 1068 aa  57  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 871 aa  56.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.76 
 
 		 1679 aa  53.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  25.47 
 
 		 2270 aa  54.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  26.55 
 
 		 2267 aa  53.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1765  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  53.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  26.26 
 
 		 2713 aa  52  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1329 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  24.89 
 
 		 1377 aa  50.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.62 
 
 		 989 aa  49.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  27 
 
 		 1247 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  40.28 
 
 		 915 aa  45.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3958  Fibronectin type III domain protein  25.85 
 
 		 662 aa  45.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>