More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2938 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  100 
 
 		 656 aa  1353    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  43.16 
 
 		 689 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  38.78 
 
 		 641 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  40 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  38.68 
 
 		 574 aa  233  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  36.16 
 
 		 562 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  34.71 
 
 		 567 aa  215  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  38.37 
 
 		 569 aa  214  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  34.62 
 
 		 329 aa  97.4  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  34.81 
 
 		 321 aa  95.5  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  38.06 
 
 		 327 aa  94.4  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  28.17 
 
 		 323 aa  92.4  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  28.17 
 
 		 323 aa  92.4  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  42.75 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  34.22 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  38 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  33.33 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  34.29 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  38.57 
 
 		 337 aa  76.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  35.66 
 
 		 754 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  32.48 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  39.29 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  39.82 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  39.18 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  39.23 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  36.69 
 
 		 333 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  33.79 
 
 		 324 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  41.18 
 
 		 299 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  36.07 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  34.76 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  41.23 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  34.31 
 
 		 198 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  38.98 
 
 		 302 aa  72  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  34.31 
 
 		 198 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  35.66 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  37.23 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  38.71 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  32.56 
 
 		 590 aa  70.5  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  33.58 
 
 		 751 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  33.13 
 
 		 824 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  31.1 
 
 		 325 aa  69.7  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  39.32 
 
 		 273 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  39.46 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  37.88 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  34.92 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  33.96 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.19 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  35.76 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  42.34 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  41.53 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  37.7 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  37.32 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  35.66 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  30.77 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  33.58 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  36.22 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  33.58 
 
 		 727 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  37.21 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  39 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  36.92 
 
 		 294 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  30.97 
 
 		 491 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  36.89 
 
 		 351 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  38.13 
 
 		 564 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  36.15 
 
 		 292 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  33.12 
 
 		 323 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  32.69 
 
 		 788 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  38.85 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.11 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  36.59 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  40.71 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.11 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  36.59 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  36 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  37.61 
 
 		 320 aa  66.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  36 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.21 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  36.59 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31.08 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.08 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  34.4 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  35.66 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  35.9 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  36.59 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  36.59 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  35.71 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  34.53 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  35.76 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  42.11 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  36.92 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  35.77 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  40.71 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  36.8 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  35.97 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  36.69 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  37.61 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  37.5 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.13 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  35.77 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>