More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0123 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  100 
 
 		 329 aa  665    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  47.3 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  42.25 
 
 		 323 aa  255  8e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  42.25 
 
 		 323 aa  255  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  34.55 
 
 		 327 aa  159  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  34.62 
 
 		 656 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  32.37 
 
 		 574 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  36.72 
 
 		 565 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  34.92 
 
 		 567 aa  95.9  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  32.28 
 
 		 562 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  33.96 
 
 		 569 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  28.51 
 
 		 641 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  30.95 
 
 		 689 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  32.97 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  31.67 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  31.67 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.03 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  33.99 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  33.99 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  33.33 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  38.05 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  37.06 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  33.33 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.71 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  31.79 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  36.52 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  33.33 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  32.68 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  32.62 
 
 		 447 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  32.48 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  30.72 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  32.03 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  31.91 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  33.54 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  33.08 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  34.4 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0013  Peptidase M23  27.2 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.958477  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.41 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  32.62 
 
 		 475 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  32.62 
 
 		 475 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  34.07 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  34.51 
 
 		 646 aa  69.3  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  36.6 
 
 		 509 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  32.62 
 
 		 474 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  36.6 
 
 		 470 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  32.88 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  32.68 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  36.6 
 
 		 512 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  29.44 
 
 		 454 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  36.6 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  36.6 
 
 		 472 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  33.07 
 
 		 681 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  29.44 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  34.51 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  30 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  30.72 
 
 		 695 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  32.52 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  33.07 
 
 		 676 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  32.67 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  35.95 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  32.87 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  29.51 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  30.59 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  34.29 
 
 		 1019 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  35.46 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  31.17 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  32.65 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  29.8 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  31.21 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.34 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  34.96 
 
 		 484 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  35.96 
 
 		 453 aa  67  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  27.14 
 
 		 417 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  30.07 
 
 		 665 aa  67  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  29.51 
 
 		 457 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  29.51 
 
 		 457 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.89 
 
 		 285 aa  67  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  34.81 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  30.71 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  30.5 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  36.84 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  30.5 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  31.5 
 
 		 674 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  31.5 
 
 		 699 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  32.45 
 
 		 477 aa  66.2  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  32.45 
 
 		 477 aa  66.2  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  32.54 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  31.5 
 
 		 697 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  33.1 
 
 		 457 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  31.5 
 
 		 697 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.59 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  26.78 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  34.87 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  31.1 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  32.91 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  32.45 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  30.71 
 
 		 569 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  32.28 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  31.82 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>