More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1169 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  100 
 
 		 323 aa  657    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  100 
 
 		 323 aa  657    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  42.86 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  42.25 
 
 		 329 aa  255  8e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  35.09 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  32.43 
 
 		 574 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  27.65 
 
 		 569 aa  99  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  33.52 
 
 		 565 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  29.41 
 
 		 641 aa  96.3  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  40.28 
 
 		 567 aa  93.2  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  28.17 
 
 		 656 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  27.25 
 
 		 562 aa  86.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  26.72 
 
 		 689 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  31.58 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  33.11 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  30.99 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  33.11 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  35.92 
 
 		 450 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  33.75 
 
 		 454 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  30.99 
 
 		 421 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  35.92 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  30.99 
 
 		 421 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  31.87 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  35.92 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  35.82 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  30.99 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  31.65 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.14 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  35.92 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  35.92 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  32.7 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  32.7 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  32.32 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  33.54 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  32.52 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.33 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  30 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  32 
 
 		 687 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  31.9 
 
 		 447 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  31.3 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0013  Peptidase M23  24 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.958477  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  30.11 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.04 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  31.51 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  33.33 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  31.29 
 
 		 468 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 475 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.33 
 
 		 473 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  29.08 
 
 		 569 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.04 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  33.09 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  33.82 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  32.09 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  31.33 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  27.95 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  32.03 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  33.09 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  31.65 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  31.3 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  33.09 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  29.01 
 
 		 649 aa  63.5  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  31.69 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  28.32 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  30.5 
 
 		 460 aa  62.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  32.82 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  34.62 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  32.08 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  30.94 
 
 		 523 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  30.99 
 
 		 475 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  32.67 
 
 		 695 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  29.77 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  29.53 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  30.77 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  30.99 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  30.99 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  27.89 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  30.56 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  29.63 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  28.48 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  31.43 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  31.5 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  31.43 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  33.63 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  31.62 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.92 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  27.33 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  30.77 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  30.77 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  27.33 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  30.32 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.45 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  30.83 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  27.46 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  28.41 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  29.56 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  32.54 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  29.48 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  29.48 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  33.63 
 
 		 676 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>