More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1758 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  100 
 
 		 321 aa  642    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  47.3 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  42.86 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  42.86 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  36.65 
 
 		 327 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  29.75 
 
 		 574 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  36.81 
 
 		 641 aa  99  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  36.6 
 
 		 569 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  34.81 
 
 		 656 aa  95.5  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  33.8 
 
 		 565 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  32.79 
 
 		 689 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  34.07 
 
 		 562 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  37.24 
 
 		 567 aa  86.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0013  Peptidase M23  29.03 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.958477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  36.64 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  32.54 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  33.54 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  29.07 
 
 		 453 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  35.04 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  28.3 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  28.66 
 
 		 399 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.76 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  28.66 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  28.3 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.56 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  34.03 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.99 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  32.17 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  34.96 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  27.33 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  27.45 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  29.68 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  35.4 
 
 		 590 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  27.04 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  27.85 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  30.34 
 
 		 490 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  27.85 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  31.29 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  35.65 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  31.34 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  31.3 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  33.04 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  32.39 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  31.39 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.55 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  32.12 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  28.65 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  31.25 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  29.41 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  27.03 
 
 		 649 aa  60.1  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  27.89 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  32.54 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.28 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  31.37 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  28.68 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  33.97 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  32.85 
 
 		 503 aa  59.3  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  33.91 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  30.43 
 
 		 674 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  32.14 
 
 		 646 aa  59.3  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  28.66 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  32 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  31.85 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  28.33 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  29.63 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  31.33 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  30.77 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  28.66 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  26.29 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  29.73 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  31.08 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  32.46 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  33.96 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  32 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  28.66 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  29.49 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  30.41 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  28.66 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  31.52 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  28.79 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  27.66 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  31.52 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  31.08 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  29.27 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  27.74 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  28.48 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  28.76 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  31.67 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  29.41 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  30.26 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  28.39 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  30.41 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  35.51 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  32.48 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  32.26 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  29.46 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  29.73 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  31.01 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  28.48 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  29.2 
 
 		 741 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>