More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1892 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1327    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  38.78 
 
 		 656 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  39.26 
 
 		 689 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  41.64 
 
 		 565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  36.34 
 
 		 569 aa  230  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  39.21 
 
 		 574 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  39.94 
 
 		 562 aa  217  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  38.25 
 
 		 567 aa  215  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  36.81 
 
 		 321 aa  99  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  29.41 
 
 		 323 aa  96.3  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  29.41 
 
 		 323 aa  96.3  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  37.78 
 
 		 327 aa  90.1  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  28.51 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  34.46 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  37.34 
 
 		 590 aa  77.4  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  38.4 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  36.29 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  39.44 
 
 		 582 aa  77  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  35.77 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  40.98 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  36.8 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  34.96 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  37.23 
 
 		 457 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  33.73 
 
 		 751 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  31.18 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  32.1 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  31.48 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  35.2 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  33.13 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.33 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  36.72 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  33.78 
 
 		 824 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  35.25 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  36.55 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  33.85 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.39 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  38.41 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  29.22 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  33.85 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  35.77 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  32.56 
 
 		 341 aa  67  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  29.03 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  29.03 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  36.51 
 
 		 293 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  36.43 
 
 		 195 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  38.18 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  38.18 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  34.69 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  35.11 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  32.2 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  30.11 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  36.44 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  32.26 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  29.94 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  29.03 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  39.2 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  32.82 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  31.88 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  32.26 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  37.4 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  31.91 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  36.13 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  31.61 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  34.33 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  34.15 
 
 		 323 aa  63.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  34.96 
 
 		 727 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  29.37 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  34.96 
 
 		 727 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  34.88 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  35.66 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  37.61 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  35.4 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  37.29 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  32.69 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  35.4 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  34.64 
 
 		 603 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  34.29 
 
 		 460 aa  62  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  35.4 
 
 		 420 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  38.94 
 
 		 360 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  37.5 
 
 		 360 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  34.64 
 
 		 603 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  32.39 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  35.4 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  37.5 
 
 		 360 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  34.9 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  37 
 
 		 484 aa  62  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  29.11 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  35.65 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  34.51 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  35.71 
 
 		 674 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  28.46 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  38.66 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  35.09 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  30 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  34.48 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  33.6 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  32.03 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  31.78 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  37 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  32.41 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>