More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06690 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1166    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  44.48 
 
 		 562 aa  462  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  40.81 
 
 		 569 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  36.61 
 
 		 574 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  32.65 
 
 		 565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  38.25 
 
 		 641 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  34.71 
 
 		 656 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  36.75 
 
 		 689 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  34.92 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  40.28 
 
 		 323 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  40.28 
 
 		 323 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  37.24 
 
 		 321 aa  96.3  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  32.94 
 
 		 327 aa  90.1  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.53 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  36.29 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  34.96 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  33.08 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  33.08 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  33.08 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  34.15 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  33.08 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  33.08 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  36.5 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  32.33 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  33.57 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  35.88 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  34.44 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  33.33 
 
 		 751 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  26.06 
 
 		 454 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  33.86 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  31.69 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  35.43 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  31.69 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  31.69 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  31.69 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  32.35 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  33.08 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  33.13 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.34 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  37.7 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  32.39 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  30.99 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  35.57 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  33.58 
 
 		 590 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  32.87 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  30.99 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  34.13 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  30.67 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  27.44 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  34.11 
 
 		 824 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  27.44 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0898  peptidase M23B  32.28 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.206308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  31.75 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  33.59 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  32.53 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  30.67 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  29.55 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.6 
 
 		 321 aa  67  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  30.99 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  32.56 
 
 		 325 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  30 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.38 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  33.33 
 
 		 313 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  33.58 
 
 		 294 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  32.85 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  29.49 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  36.17 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  33.58 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  30.14 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  30.82 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  34.44 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  33.33 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  31.01 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  31.01 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  33.33 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  33.11 
 
 		 687 aa  64.7  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  31.97 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  37.01 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  28.68 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  29.93 
 
 		 727 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  29.93 
 
 		 727 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  33.08 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  32.8 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  31.36 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  32.28 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  30.28 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  33.33 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  29.13 
 
 		 646 aa  63.5  0.000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  29.23 
 
 		 569 aa  63.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  33.1 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.82 
 
 		 464 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  34.65 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  31.54 
 
 		 377 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  31.03 
 
 		 300 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  33.07 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  32.89 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  32.28 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  29.7 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  34.65 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  37.1 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>