More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1724 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  100 
 
 
569 aa  1170    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  40.81 
 
 
567 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  39.74 
 
 
562 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  35.93 
 
 
565 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  33.4 
 
 
574 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  36.34 
 
 
641 aa  230  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  38.37 
 
 
689 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  38.37 
 
 
656 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  27.65 
 
 
323 aa  99  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  27.65 
 
 
323 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  36.6 
 
 
321 aa  97.8  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  33.96 
 
 
329 aa  89  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  31.36 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  36.61 
 
 
337 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  38.93 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  39.29 
 
 
582 aa  71.6  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  35.09 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  31.88 
 
 
450 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.1 
 
 
420 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  35.09 
 
 
333 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  37.1 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  31.88 
 
 
345 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  36.29 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  36.29 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  36.29 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  36.29 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  30.71 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  32 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  33.87 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  33.6 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  36.92 
 
 
457 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  33.6 
 
 
512 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  33.58 
 
 
499 aa  67  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  35.65 
 
 
317 aa  67  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.05 
 
 
321 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  41.03 
 
 
268 aa  67  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  33.87 
 
 
509 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  31.16 
 
 
457 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  33.04 
 
 
457 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  33.87 
 
 
470 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  31.16 
 
 
457 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  36.97 
 
 
293 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  38.81 
 
 
320 aa  66.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  37.19 
 
 
299 aa  66.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  38.93 
 
 
274 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  36.29 
 
 
425 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  37.5 
 
 
324 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  34.82 
 
 
302 aa  65.1  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  32.17 
 
 
507 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  34.9 
 
 
354 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  35.4 
 
 
317 aa  63.9  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  36.44 
 
 
305 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  30.82 
 
 
337 aa  63.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  32.31 
 
 
198 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  37.61 
 
 
452 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  33.61 
 
 
399 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  29.03 
 
 
362 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  36.13 
 
 
317 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  36 
 
 
387 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  32.31 
 
 
198 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  33.61 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  33.93 
 
 
646 aa  62  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  40.32 
 
 
352 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  34.75 
 
 
360 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  34.75 
 
 
360 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  34.75 
 
 
360 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  34 
 
 
308 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  35.45 
 
 
333 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  35.71 
 
 
316 aa  61.6  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  37.58 
 
 
448 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  35.16 
 
 
453 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.82 
 
 
274 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  30.77 
 
 
687 aa  61.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  33.8 
 
 
300 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.15 
 
 
376 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  33.07 
 
 
414 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.4 
 
 
343 aa  60.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  38.02 
 
 
251 aa  60.8  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  30.95 
 
 
754 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  38.39 
 
 
253 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  34.13 
 
 
230 aa  60.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  33.33 
 
 
569 aa  59.7  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  33.85 
 
 
447 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  35.92 
 
 
603 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  35.92 
 
 
603 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  35.25 
 
 
482 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  33.85 
 
 
447 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  35.16 
 
 
349 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  33.33 
 
 
302 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  32.19 
 
 
357 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  31.78 
 
 
824 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  31.18 
 
 
490 aa  60.1  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  36.84 
 
 
309 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  36.44 
 
 
374 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  34.13 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  29.38 
 
 
325 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  36.61 
 
 
282 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  34.65 
 
 
449 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  32.05 
 
 
229 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  33.07 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>