More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0119 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  100 
 
 
562 aa  1148    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  44.48 
 
 
567 aa  445  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  39.74 
 
 
569 aa  355  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  37.46 
 
 
574 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  34.97 
 
 
565 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  36.16 
 
 
656 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  39.94 
 
 
641 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  38.49 
 
 
689 aa  197  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  34.07 
 
 
321 aa  90.9  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  32.28 
 
 
329 aa  90.9  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  27.25 
 
 
323 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  27.25 
 
 
323 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  31.58 
 
 
327 aa  76.6  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  35.22 
 
 
582 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  36.64 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0013  Peptidase M23  26.05 
 
 
284 aa  72  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.958477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  34.35 
 
 
317 aa  67  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  36.51 
 
 
324 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  33.55 
 
 
347 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  26.52 
 
 
454 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  34.35 
 
 
302 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  34.85 
 
 
302 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  34.03 
 
 
300 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  37.17 
 
 
313 aa  64.3  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  27.17 
 
 
457 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  27.17 
 
 
457 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  35.4 
 
 
425 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  34.65 
 
 
337 aa  62.4  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
300 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  36.36 
 
 
308 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  33.04 
 
 
337 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  34.35 
 
 
457 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  34.85 
 
 
323 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  35.4 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  33.59 
 
 
325 aa  62  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.53 
 
 
323 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.9 
 
 
305 aa  62  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  37.93 
 
 
453 aa  62  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  33.07 
 
 
325 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  35.2 
 
 
352 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  34.51 
 
 
400 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  34.51 
 
 
421 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  31.75 
 
 
450 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  34.51 
 
 
421 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  31.58 
 
 
333 aa  60.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  31.62 
 
 
354 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  33.93 
 
 
271 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  32.37 
 
 
362 aa  60.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  31.75 
 
 
345 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  34.48 
 
 
499 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  31.75 
 
 
457 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  34.51 
 
 
412 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  31.3 
 
 
414 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  34.51 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  34.72 
 
 
286 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  34.51 
 
 
314 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  30.77 
 
 
274 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  33.1 
 
 
512 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  30.77 
 
 
255 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  33.1 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  33.1 
 
 
472 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  32.65 
 
 
268 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  30.71 
 
 
333 aa  58.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  33.79 
 
 
470 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  33.79 
 
 
509 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.17 
 
 
569 aa  58.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  35.29 
 
 
299 aa  58.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  28.95 
 
 
395 aa  58.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  34.06 
 
 
452 aa  58.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  35.29 
 
 
296 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  38.39 
 
 
251 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  32.89 
 
 
388 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  32.03 
 
 
286 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  36.89 
 
 
317 aa  57.4  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  31.5 
 
 
341 aa  57.8  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  32.14 
 
 
310 aa  57.4  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  34.21 
 
 
293 aa  57  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  30.71 
 
 
318 aa  57  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  31.16 
 
 
687 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  34.48 
 
 
387 aa  56.6  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  27.13 
 
 
323 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  30.34 
 
 
458 aa  56.6  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  36.13 
 
 
374 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.88 
 
 
343 aa  56.2  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  33.93 
 
 
646 aa  56.2  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  31.43 
 
 
603 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  29.09 
 
 
447 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  31.06 
 
 
270 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  32.39 
 
 
564 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  31.43 
 
 
603 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  28.92 
 
 
383 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  29.09 
 
 
447 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  34.04 
 
 
428 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  30.51 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  34.21 
 
 
313 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  31.69 
 
 
419 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  35.35 
 
 
507 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  32.54 
 
 
430 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  29.31 
 
 
433 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  29.1 
 
 
223 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>