More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1179 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  100 
 
 		 565 aa  1174    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  35.38 
 
 		 574 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  34.97 
 
 		 562 aa  315  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  35.93 
 
 		 569 aa  298  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  32.65 
 
 		 567 aa  293  6e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  41.64 
 
 		 641 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  40 
 
 		 656 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  38.37 
 
 		 689 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  36.72 
 
 		 329 aa  96.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  33.52 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  33.52 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  33.8 
 
 		 321 aa  94  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  38.85 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  31.72 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  40.3 
 
 		 268 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.11 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  36.13 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  39.23 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  34.97 
 
 		 302 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  35.11 
 
 		 302 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  35.66 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  39.39 
 
 		 323 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  38.05 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  38.89 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  38.28 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  36.04 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  31.61 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  35.48 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  34.97 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  37.6 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  32.05 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  33.33 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  34.72 
 
 		 286 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  36.8 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  34.68 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  31.18 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  33.33 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0898  peptidase M23B  34.9 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.206308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  28.65 
 
 		 687 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  40.65 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  36.8 
 
 		 400 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  37.9 
 
 		 754 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  36.8 
 
 		 421 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  36.8 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  35.16 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  34.46 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  37.9 
 
 		 590 aa  70.1  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  32.48 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  37.41 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  31.78 
 
 		 323 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  34.96 
 
 		 317 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  38.46 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  38.41 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  31.29 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  33.11 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  35.29 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  30.25 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  34.38 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  30.25 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  37.84 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  37.68 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  40.18 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  38.41 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  36.59 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  37.5 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  35.16 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  36.84 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  26.7 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  33.59 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  40 
 
 		 448 aa  67  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  32.28 
 
 		 325 aa  67  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  34.13 
 
 		 472 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  35.51 
 
 		 195 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  35.04 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  34.13 
 
 		 512 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  34.13 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  33.33 
 
 		 499 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  34.13 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  36.15 
 
 		 274 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  32.12 
 
 		 695 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  34.13 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  35.66 
 
 		 274 aa  67  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  34.62 
 
 		 411 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  33.97 
 
 		 293 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  36.51 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  33.09 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  33.11 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  36.36 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  32.17 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  33.07 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  29.22 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  34.13 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  34.23 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  33.59 
 
 		 198 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  36.05 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  36.05 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.59 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35.16 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  30.07 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>