More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0881 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0881  Peptidase M23  100 
 
 
574 aa  1171    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0119  peptidase M23B  37.46 
 
 
562 aa  352  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1179  Peptidase M23  35.38 
 
 
565 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06690  hypothetical protein  36.61 
 
 
567 aa  326  6e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1724  Peptidase M23  33.4 
 
 
569 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0531852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2938  Peptidase M23  38.68 
 
 
656 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1892  hypothetical protein  39.21 
 
 
641 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0978  Peptidase M23  37.97 
 
 
689 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228499  normal  0.143829 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1131  peptidase M23B  32.43 
 
 
323 aa  107  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000945078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1169  peptidase M23  32.43 
 
 
323 aa  107  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00718069  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1758  peptidase M23B  29.75 
 
 
321 aa  105  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000326005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0123  peptidase M23B  32.37 
 
 
329 aa  97.4  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1382  peptidase M23B  25.72 
 
 
327 aa  90.9  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  36.15 
 
 
325 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  36.92 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  41.18 
 
 
299 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  35.38 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  37.5 
 
 
337 aa  76.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  37.72 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  38.05 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  35.61 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  36.07 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  35.9 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  34.78 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0013  Peptidase M23  30.66 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.958477  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  35.11 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  38.05 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  37.5 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  34.56 
 
 
268 aa  72  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.28 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  38.66 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  36.23 
 
 
582 aa  70.9  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  36.28 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
300 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  38.17 
 
 
457 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  33.59 
 
 
286 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.92 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  33.08 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  32.67 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  30.64 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  28.57 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  31.54 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  32.64 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  34.38 
 
 
453 aa  67  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  34.51 
 
 
387 aa  67  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  31.71 
 
 
453 aa  67  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  39.17 
 
 
331 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  30.83 
 
 
646 aa  66.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  33.33 
 
 
452 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  32.33 
 
 
293 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  33.33 
 
 
465 aa  65.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  31.88 
 
 
448 aa  64.7  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  32.46 
 
 
524 aa  64.7  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  37.07 
 
 
251 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  32.03 
 
 
308 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  35.46 
 
 
460 aa  64.7  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  27.93 
 
 
340 aa  64.7  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  36 
 
 
320 aa  64.7  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  36.13 
 
 
296 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  35.29 
 
 
434 aa  64.3  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  33.83 
 
 
569 aa  64.3  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  36.61 
 
 
273 aa  63.9  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  28.57 
 
 
301 aa  63.9  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  28.93 
 
 
414 aa  63.5  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.51 
 
 
343 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  31.86 
 
 
454 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  34.55 
 
 
333 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  31.62 
 
 
231 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  35.16 
 
 
388 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35.34 
 
 
301 aa  63.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  30.52 
 
 
352 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  31.58 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  33.33 
 
 
238 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  36.28 
 
 
459 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  31.21 
 
 
233 aa  62.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  29.37 
 
 
270 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  36.28 
 
 
456 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  31.58 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  29.93 
 
 
274 aa  62.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  35.71 
 
 
262 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  32.14 
 
 
687 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  31.5 
 
 
229 aa  62  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  30.16 
 
 
300 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  33.93 
 
 
470 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.63 
 
 
314 aa  61.6  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  35.4 
 
 
457 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  29.91 
 
 
287 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  31.25 
 
 
674 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  33.04 
 
 
353 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  29.23 
 
 
283 aa  60.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  32.2 
 
 
465 aa  60.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  34.92 
 
 
278 aa  60.8  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  30.71 
 
 
464 aa  60.8  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  30.4 
 
 
354 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  30.77 
 
 
412 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  35.9 
 
 
334 aa  60.8  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  35.96 
 
 
293 aa  60.8  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  32.23 
 
 
490 aa  60.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  31.86 
 
 
300 aa  60.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  31.58 
 
 
446 aa  60.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>