More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2328 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  42.06 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 242 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  43.41 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  35.94 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  34.38 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 149 aa  84  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  36 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  37.16 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  31.39 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  27.94 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  33.85 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  33.85 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4528  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  37.96 
 
 		 306 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 292 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3819  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.752966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  28.36 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  33.58 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  27.78 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0036  two component LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 221 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0464925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  26.98 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  29.1 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 868 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  27.07 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.46 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  36 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 381 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  30.53 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 531 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 367 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4012  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.786329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  32.5 
 
 		 531 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>