216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2035 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 379 aa  791    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  57.78 
 
 		 377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  40 
 
 		 375 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 		 378 aa  239  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 		 375 aa  228  9e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  32.96 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.44 
 
 		 398 aa  116  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  26.76 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 443 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.42 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  23.16 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  22.86 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  22.73 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  24.02 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1188  monooxygenase, FAD-binding  23.89 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  26.07 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  26.07 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  22.57 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  22.57 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.16 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.25 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  23.88 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  24.43 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  24.65 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  23.2 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  23.64 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  25.85 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  23.3 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  25.3 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  25.64 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  24.36 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  20.97 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  23.32 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  20.74 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  21.53 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  20.05 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  21.89 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  25.75 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  22.07 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  20.74 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  22.38 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.85 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  22.92 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  22.67 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  26.32 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  22.38 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  32.42 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  33.55 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  22.92 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  21.53 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  21.91 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  22.56 
 
 		 455 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  22.08 
 
 		 338 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  22.54 
 
 		 396 aa  53.1  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.85 
 
 		 439 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.85 
 
 		 439 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  21.53 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  23.69 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  25.39 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  22.38 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  23.03 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  19.43 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  22.01 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  23.82 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  22.12 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3875  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  21.61 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296611  normal  0.796708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  22.35 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  23.13 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  21.35 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.64 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  21.76 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  22.76 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  21.89 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4710  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  23.1 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  21.9 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  45.61 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  21.13 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0323  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.94 
 
 		 409 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  21.08 
 
 		 431 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  22.16 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>