More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1474 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 339 aa  692    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6059  signal transduction histidine kinase, LytS  57.99 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  53.39 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7150  signal transduction histidine kinase, LytS  48.95 
 
 		 345 aa  329  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  42.92 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0757  signal transduction histidine kinase, LytS  42.5 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.836755  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2660  signal transduction histidine kinase, LytS  39.56 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  35.53 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  44 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  35.84 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  41.18 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  32.95 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  38.99 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0272  signal transduction histidine kinase, LytS  42.86 
 
 		 352 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6407  signal transduction histidine kinase, LytS  32.9 
 
 		 355 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  38.66 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  36.67 
 
 		 375 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  37.24 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  39.9 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0836  signal transduction histidine kinase, LytS  40.8 
 
 		 380 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0857  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  30.9 
 
 		 445 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2090  signal transduction histidine kinase, LytS  41.03 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0316441  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  38.07 
 
 		 1021 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2776  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0308  signal transduction histidine kinase, LytS  38.38 
 
 		 357 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0601  signal transduction histidine kinase, LytS  33.98 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  34.91 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0799  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3230  signal transduction histidine kinase, LytS  38.46 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  32.34 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  27.18 
 
 		 333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1793  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 391 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5825  signal transduction histidine kinase, LytS  36.73 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.466187  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2255  signal transduction histidine kinase, LytS  29.97 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1788  signal transduction histidine kinase, LytS  38.14 
 
 		 448 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992442  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  34.6 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  35 
 
 		 563 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  35.53 
 
 		 563 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1210  histidine kinase internal region  34.78 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2254  signal transduction histidine kinase, LytS  27.5 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.694185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 		 393 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0805  signal transduction histidine kinase, LytS  35.43 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 		 557 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 561 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  32.28 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 561 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  30.69 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  30.69 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  30.69 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  32.05 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  33.12 
 
 		 575 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  30.69 
 
 		 561 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  32.04 
 
 		 405 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  33.17 
 
 		 569 aa  99.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 556 aa  99.4  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 		 578 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  31.19 
 
 		 562 aa  99.4  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 561 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  30.65 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  29.39 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  32.58 
 
 		 576 aa  96.3  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1792  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  34.38 
 
 		 556 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  32.74 
 
 		 432 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  25.93 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4669  signal transduction histidine kinase, LytS  27.59 
 
 		 523 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.959572  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  33.74 
 
 		 558 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  35 
 
 		 577 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 565 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0602  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  29.12 
 
 		 400 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  34.38 
 
 		 556 aa  92.8  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  34.27 
 
 		 380 aa  92.4  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 		 558 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  31.55 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  32.28 
 
 		 561 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  31.52 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  34.53 
 
 		 591 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  30.56 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  30.77 
 
 		 576 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  33.9 
 
 		 568 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  29.11 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  32.75 
 
 		 565 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  31.34 
 
 		 565 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0722  signal transduction histidine kinase, LytS  31.65 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  32.52 
 
 		 558 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  32.31 
 
 		 565 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 572 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  31.73 
 
 		 580 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  31.05 
 
 		 572 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>