More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0696 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0696  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  522  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225842  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  42.06 
 
 
234 aa  208  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  31.44 
 
 
297 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  31.06 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  36.14 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  35.29 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 
297 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 
297 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 
297 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 
297 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 
297 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  35.29 
 
 
302 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  33.82 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
309 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  32.78 
 
 
315 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0690  ABC transporter related  33.64 
 
 
319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  33.04 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  33.47 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  35 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.39 
 
 
338 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  31.28 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0594  ABC transporter related  32.7 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  32.91 
 
 
300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  31.53 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.36 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  31.1 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  32.44 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  34.7 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  31.65 
 
 
298 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
305 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  32.52 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  32.74 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  30.91 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 
307 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  34.39 
 
 
345 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  32.46 
 
 
292 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  35 
 
 
305 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  29.81 
 
 
321 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  31.43 
 
 
291 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  31.7 
 
 
306 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  32.28 
 
 
293 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  31.7 
 
 
307 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  33.64 
 
 
326 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
309 aa  123  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  30.31 
 
 
244 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  30.23 
 
 
332 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  34.76 
 
 
251 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  29.09 
 
 
303 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  31.39 
 
 
293 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 
296 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  30.31 
 
 
244 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  30.31 
 
 
244 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 
308 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  33.48 
 
 
345 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  31.39 
 
 
340 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  31.84 
 
 
296 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  29.07 
 
 
298 aa  122  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.88 
 
 
324 aa  122  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  35.07 
 
 
299 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  30.43 
 
 
304 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  30.91 
 
 
309 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
308 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  30.92 
 
 
320 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  30.56 
 
 
293 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  30.43 
 
 
326 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  31.8 
 
 
303 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  30.31 
 
 
244 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 
312 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  32.99 
 
 
291 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  34.38 
 
 
318 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  30.36 
 
 
308 aa  121  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  30.31 
 
 
244 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  32.44 
 
 
316 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  30.31 
 
 
244 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  29.92 
 
 
244 aa  121  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.73 
 
 
302 aa  122  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  30.43 
 
 
304 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  31.62 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  30.49 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  29.92 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  30.43 
 
 
304 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  31.5 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  30.43 
 
 
304 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  32.59 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  28.57 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  29.79 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
369 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  30.18 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  35.24 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  34.39 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  29.95 
 
 
373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  30.23 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  32.99 
 
 
293 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2238  ABC transporter related  31.14 
 
 
246 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0769136  normal  0.0562594 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  31.67 
 
 
295 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>