168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1002 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  90.55 
 
 		 254 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  89.37 
 
 		 254 aa  414  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  37.67 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  36.12 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  36.97 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  35.07 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  35.24 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  35.24 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  31.05 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  31.75 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  31.75 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  31.75 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  32.42 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  35.68 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  35.58 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  32.79 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  30.7 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  33.18 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  34.43 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  35.55 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  32.7 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  32.38 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  33.18 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  32.7 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  30.88 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  32.08 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  35.51 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  32.23 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  32.23 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  31.6 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4151  hypothetical protein  31.6 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  33.17 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  32.35 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  29.69 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  33.17 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  29.72 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  32.11 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  36.54 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  35.1 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  29.9 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  33.18 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  29.22 
 
 		 237 aa  95.5  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  30.77 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  30.16 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  32.53 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  29.86 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  31.71 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  30.16 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  30.29 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  32.54 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  32.93 
 
 		 233 aa  92  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30.28 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  33.8 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  31.73 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  29.33 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  33.17 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  32.75 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  30.2 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  33.65 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  31.28 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  31.43 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  31.43 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  34.57 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  31.94 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  30.29 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  28.39 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4106  hypothetical protein  31.87 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.62913e-48 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  30.94 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  27.65 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  33.94 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  31.36 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  34.19 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2416  hypothetical protein  30.36 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193753  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  31.31 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1487  hypothetical protein  34.45 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  31.14 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  28.36 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  26.64 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  32 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  35.29 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0288  protein of unknown function DUF541  26.81 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  29.17 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1489  protein of unknown function DUF541  32.79 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  30.19 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0882  protein of unknown function DUF541  29.38 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  24.88 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2473  protein of unknown function DUF541  34.34 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.065986  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1360  hypothetical protein  29.41 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.412374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  29.68 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  30.95 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  29.73 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  26.54 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  27.27 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  27.72 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1523  hypothetical protein  30.26 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811201  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  30.56 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  28.29 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  28.29 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>