259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2045 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.57 
 
 
213 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  55.35 
 
 
213 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3690  HAD superfamily hydrolase  48.1 
 
 
216 aa  201  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0426  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.32 
 
 
213 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1591  HAD family hydrolase  33.48 
 
 
229 aa  135  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  36.76 
 
 
225 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1599  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.23 
 
 
211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0287607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1789  HAD superfamily hydrolase  32.04 
 
 
227 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0761  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.07 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2667  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.73 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.66 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  28.26 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  29.73 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1530  hydrolase  29.26 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  26.24 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  26.89 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.13 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.43 
 
 
456 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  27.83 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14011  hypothetical protein  25.28 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.88 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  28.28 
 
 
188 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  28.28 
 
 
188 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  28.28 
 
 
188 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  29.23 
 
 
256 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  27.45 
 
 
456 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25280  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.98 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0213796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  25.97 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  26.7 
 
 
456 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  26.4 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  27.86 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  24.74 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  26.8 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  25 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  25 
 
 
216 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  28.19 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.24 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  24.5 
 
 
468 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.5 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  28.34 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.63 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  25.96 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  26.97 
 
 
188 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  26.42 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.73 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  26.64 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  28.7 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  29.2 
 
 
188 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1312  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.92 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  29.58 
 
 
454 aa  52  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.55 
 
 
217 aa  52  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.59 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
242 aa  51.6  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.78 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  30.21 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.29 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  31.11 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.62 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  27.46 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  28.97 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.39 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000889  putative phosphatase  27.08 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.47 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  27.01 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  28.19 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  25.37 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  28.33 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 
241 aa  48.9  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  22.22 
 
 
214 aa  49.3  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.08 
 
 
227 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  29.61 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.87 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  28.08 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  24.39 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  24.48 
 
 
396 aa  48.5  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
256 aa  48.5  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  27.87 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.43 
 
 
224 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 
226 aa  48.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  28.06 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.06 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  28.06 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  28.06 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  28.06 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  23.16 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.26 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  27.59 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  23.08 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  27.32 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.18 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3281  HAD family hydrolase  27.75 
 
 
221 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
272 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>