More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3668 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3668  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  100 
 
 
315 aa  633  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3826  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  81.27 
 
 
315 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0263  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  71.1 
 
 
321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0272  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  70.68 
 
 
321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3725  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  66.45 
 
 
310 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0948843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3628  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  66.45 
 
 
310 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0802422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3663  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  66.45 
 
 
310 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.915768  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  66.45 
 
 
310 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  66.45 
 
 
310 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03101  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  66.45 
 
 
310 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  66.13 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03052  hypothetical protein  66.45 
 
 
310 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3430  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  66.13 
 
 
310 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0465  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  66.45 
 
 
310 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  66.13 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3537  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  66.45 
 
 
310 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3678  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  65.16 
 
 
310 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0484  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  68.37 
 
 
311 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4558  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  66.13 
 
 
309 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1176  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  68.69 
 
 
311 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00539162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4391  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  68.08 
 
 
311 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0420  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  67.41 
 
 
311 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  41.61 
 
 
299 aa  225  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  42.71 
 
 
302 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  43.93 
 
 
289 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  42.71 
 
 
288 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  42.55 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  41.64 
 
 
337 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  43.53 
 
 
324 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  43.53 
 
 
324 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  40.7 
 
 
291 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  40.7 
 
 
291 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  42.29 
 
 
334 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  40.7 
 
 
291 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  43.01 
 
 
316 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  40.91 
 
 
295 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  41.52 
 
 
291 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  43.12 
 
 
322 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  38.44 
 
 
315 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  41.88 
 
 
308 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0215  secretion protein HlyD  41.24 
 
 
314 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.509726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 
289 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.44 
 
 
314 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.27 
 
 
336 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  42.62 
 
 
305 aa  202  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  42.6 
 
 
284 aa  202  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  39.39 
 
 
287 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 
287 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  41.9 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  39.35 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  38.51 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.26 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  43.02 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  40.49 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  41.36 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  40.33 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  39.79 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.35 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  43.4 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  39.35 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  41.51 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  41.31 
 
 
294 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  40.21 
 
 
351 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  40.2 
 
 
300 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  40.91 
 
 
288 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  42.91 
 
 
328 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 
299 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  41.44 
 
 
327 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  39.44 
 
 
285 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  41.1 
 
 
293 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  43 
 
 
311 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  39.4 
 
 
334 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  39.65 
 
 
317 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  40.53 
 
 
359 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  40.3 
 
 
359 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  39.24 
 
 
334 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  38.01 
 
 
302 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.8 
 
 
316 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  39 
 
 
286 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  38.79 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  38.43 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  44.32 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  44.32 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  37.81 
 
 
286 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 
344 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.1 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  38.1 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1954  secretion protein HlyD  39.86 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  38.1 
 
 
285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  37.81 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 
285 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  38.1 
 
 
285 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  37.27 
 
 
302 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  37.73 
 
 
285 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 
285 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  37.28 
 
 
291 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 
286 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>