122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3137 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  100 
 
 
570 aa  1159    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  50.52 
 
 
592 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  50.09 
 
 
587 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  44.07 
 
 
602 aa  482  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  44.63 
 
 
610 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  47.13 
 
 
600 aa  445  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  41.53 
 
 
599 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  46.38 
 
 
640 aa  352  8.999999999999999e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  40.14 
 
 
563 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  38.84 
 
 
546 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  35.13 
 
 
545 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  26.35 
 
 
627 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  25.31 
 
 
637 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  29.54 
 
 
587 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  27.76 
 
 
580 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  27.76 
 
 
580 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  28.62 
 
 
991 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  26.61 
 
 
998 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  24.48 
 
 
584 aa  87.8  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  24.48 
 
 
584 aa  87.8  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  25.98 
 
 
998 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  27.33 
 
 
629 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  26.01 
 
 
615 aa  73.9  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  27.61 
 
 
557 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.9 
 
 
585 aa  70.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  27.12 
 
 
633 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  24.31 
 
 
589 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  20.45 
 
 
592 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  20.45 
 
 
592 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  25.71 
 
 
563 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  25 
 
 
577 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  25.46 
 
 
1148 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  26.56 
 
 
655 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  23.1 
 
 
588 aa  67  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  23.01 
 
 
613 aa  67  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  24.87 
 
 
577 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25.33 
 
 
562 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  26.81 
 
 
655 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.54 
 
 
612 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  23.64 
 
 
575 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  21.53 
 
 
619 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  23.01 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  23.01 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  23.01 
 
 
612 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.01 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  22.78 
 
 
610 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  22.68 
 
 
613 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  24.38 
 
 
610 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.68 
 
 
612 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  26.17 
 
 
1153 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  21.84 
 
 
575 aa  61.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  25.62 
 
 
611 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.63 
 
 
656 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.63 
 
 
656 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  23.15 
 
 
604 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  25.23 
 
 
577 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  24.82 
 
 
617 aa  58.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  24.34 
 
 
578 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  24.34 
 
 
578 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  23.52 
 
 
720 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  23.28 
 
 
618 aa  57.4  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  25.75 
 
 
608 aa  57  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.69 
 
 
653 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  19.58 
 
 
585 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  19.58 
 
 
585 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  23.9 
 
 
614 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  24.22 
 
 
580 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  22.83 
 
 
604 aa  54.7  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  25.31 
 
 
609 aa  53.9  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  25.16 
 
 
635 aa  53.9  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  25.87 
 
 
570 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  23.79 
 
 
608 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  24.34 
 
 
637 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  23.91 
 
 
580 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  25.12 
 
 
645 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  23.47 
 
 
591 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  25.07 
 
 
582 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  23.19 
 
 
642 aa  51.2  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  26.24 
 
 
615 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  26.82 
 
 
593 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  26.7 
 
 
594 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  25.93 
 
 
589 aa  50.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  23.96 
 
 
607 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  26.01 
 
 
599 aa  50.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  22.61 
 
 
642 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  22.58 
 
 
642 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  23.47 
 
 
625 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  23.89 
 
 
610 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  22.58 
 
 
642 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  19.87 
 
 
560 aa  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  24.94 
 
 
596 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  24.85 
 
 
578 aa  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  22.58 
 
 
642 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  23.72 
 
 
614 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  23.53 
 
 
582 aa  48.5  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  23.53 
 
 
582 aa  48.5  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  23.72 
 
 
614 aa  48.5  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  24.28 
 
 
596 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0588  putative siderophore biosynthesis protein  24.56 
 
 
564 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  21.59 
 
 
615 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>