More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1439 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1439  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 301 aa  610  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2620  transcriptional regulator, LysR family  66.78 
 
 		 299 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0014  transcriptional regulator, LysR family  57.39 
 
 		 298 aa  338  7e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.12063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0014  transcriptional regulator, LysR family  57.39 
 
 		 298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.29 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  28.67 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  32.73 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.66 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.73 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6967  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.57 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.64 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.18 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.04 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.18 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  29.18 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.18 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.18 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.18 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.18 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.7 
 
 		 313 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.7 
 
 		 313 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.79 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.72 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3435  transcriptional regulator, LysR family  29.31 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  28.04 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.44 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6638  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863309  normal  0.341434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2441  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96584 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2536  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  27.54 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.84 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.84 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.84 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.84 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6544  transcriptional regulator, LysR family  23.26 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0395202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.44 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5454  transcriptional regulator, LysR family  25.6 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5103  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 403 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4707  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3713  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0343753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>