More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0596 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  84.8 
 
 		 204 aa  347  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  77.45 
 
 		 204 aa  332  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  78.82 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.34 
 
 		 204 aa  322  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  73.56 
 
 		 222 aa  295  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  75.37 
 
 		 204 aa  293  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  75.49 
 
 		 204 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  75.98 
 
 		 204 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  74.38 
 
 		 204 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 		 209 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.89 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  35.68 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  36.22 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  35.2 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  34.34 
 
 		 203 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  35.32 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  34.52 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  35.15 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  34.52 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.31 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  35.79 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 212 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  37.24 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  34.69 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.6 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.6 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  37.16 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  29.83 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  29.83 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  31.28 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  29.95 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  31.28 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.25 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  31.98 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 		 210 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.93 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  34.42 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  34.03 
 
 		 204 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  31.71 
 
 		 213 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  32.16 
 
 		 213 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  32.11 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  28.77 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  30.62 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  32.7 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.62 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.62 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.62 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.62 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.62 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  32.63 
 
 		 204 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  33.18 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  32.7 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  32.7 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  33.18 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  31.68 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  31.88 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  32.7 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  32.7 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  31.88 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  32.85 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  31.88 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  32.7 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  30.48 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.88 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 		 212 aa  98.6  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  30.92 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  30.92 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>